河海工科大学曾是中国历史上的一所著名国立工科大学，1924年到1927年间立校于南京。设水利、土木、机械、电机等系科。历任校长有
茅以升（1924年7月 - 1925年8月）、
杨孝述（1925年8月 - 1927年6月）。
河海工科大学的前身是
国立东南大学工科和
河海工程专门学校。 河海工程专门学校成立于1915年，是中国历史上第一所专门培养水利工程人才的高等学府。许肇南、严善坊先后担任校长。
国立东南大学工科的前身是1918年在
南京高等师范学校图画手工科基础上成立的工艺专修科；1921年，
南京高等师范学校改建为
国立东南大学，工艺专修科改为工科。
杨杏佛、
茅以升等人先后担任工艺专修科、工科主任。
1924年4月，
国立东南大学校董事会议因经费困难决定停办工科；8月，校董会复议暂行停办工科案。经过讨论，最后议决：“此项办法既与停办之原案不相抵触，又于学生转学上不发生困难，本会认为可行。”于是
国立东南大学的工科于1924年秋从
国立东南大学划出，与河海工程专门学校组建成了国立河海工程大学。后与中国水利局取得一致意见，以
国立东南大学工科机械、土木、电机三系与河海工程学校为基础改组为国立河海工科大学，由原工科主任茅以升出任河海工大首任校长。
1927年8月，河海工科大学并入
中央大学（初名
第四中山大学，旋先后改名江苏大学、中央大学），成为工学院；1949年，
国立中央大学改名
国立南京大学，1950年改名
南京大学。
1952年，院系重组，老南京大学工学院独立建立南京工学院，水利系分出，成立
华东水利学院等校，1985年，华东水利学院改名
河海大学。
河海工科大学是今河海大学的前身。河海大学（华东水利学院）的直接前身是
河海工程专门学校（
南京大学工学院水利系）。