‌浙江大学生物系统工程与食品科学学院（简称“生工食品学院”）‌是由原浙江大学农业工程学院和浙江大学食品科学与营养系于1999年合并组建而成的浙江大学二级学院。

1956年，浙江农学院农学系设立农业生产机械化专业。

1960年，原浙江农学院农学系农业生产机械化专业与原浙江大学机械系农业设计制造专业合并成立浙江农业大学农业机械系。

1968年，浙江农业大学设立农产品综合利用专业。

1984年，浙江农业大学成立食品工程系。

1985年，浙江农业大学农业机械系更名为农业工程系，食品工程系更名为食品科技系。

1993年，浙江农业大学与浙江省机械厅合作，在浙江农业大学农业工程系基础上成立工程技术学院。

1998年，浙江农业大学工程技术学院更名为农业工程学院。

1998年，四校合并新浙江大学成立。浙江农业大学农业工程学院更名为浙江大学农业工程学院，浙江农业大学食品科技系更名为浙江大学食品科学与营养系。

1999年，浙江大学农业工程学院和浙江大学食品科学与营养系合并组建成立浙江大学农业工程与食品科学学院。

2002年，浙江大学农业工程与食品科学学院更名为浙江大学生物系统工程与食品科学学院。

学院现设有生物系统工程、食品科学与营养2个系，1个教学实验中心，农业生物环境工程、智能农业装备、农业信息技术、食品加工工程、食品生物科学技术等5个研究所。

学院拥有农业工程、食品科学与工程2个一级学科博士学位授予点和2个一级学科博士后流动站，拥有农业机械化工程等10个二级学科硕士学位授予点，农业工程、食品科学与工程2个本科专业。农业工程一级学科2017年入选国家“双一流”建设学科，是浙江大学高峰建设学科，在第四轮学科评估中位列A+序列；食品科学与工程一级学科是浙江大学优势特色建设学科，在第四轮学科评估中位列A-序列。

学院农业工程、食品科学与工程两个本科专业入选国家一流本科专业建设点，食品科学与工程专业通过IFT国际认证。获国家级教学成果奖一等奖1项、二等奖1项，建有国家精品课程3门、国家精品视频公开课1门。

学院建有国家地方联合工程实验室1个、农业农村部重点实验室4个、浙江省重点实验室1个，以及浙江省国际科技合作基地2个；建有3个浙江省重点科技创新团队、2个农业农村部农业科研杰出人才及其创新团队。形成了智能农业装备、智慧农业、农产品无损检测、设施农业（水产）环境工程与装备、食品加工工程与装备、食物资源综合开发利用、食品营养与健康及食品物流和品质保障等优势特色研究方向。

近五年来，学院承担科研课题450余项，其中国家级科研课题77项（其中国家自然科学基金63项、国家科技支撑课题6项、国家“863”计划项目1项、国家“863”计划课题5项、国家973计划课题2项），省部级科研课题80余项（其中省科技创新团队2项，重点课题6项、浙江省杰出青年科学基金4项），横向重大科研课题3项；获省部级以上科技奖励17项（其中以第一完成单位获国家技术发明奖二等奖1项，教育部科技进步奖一等奖3项，教育部技术发明家一等奖1项，教育部自然科学奖一等奖1项，浙江省科学技术一等奖4项），发表SCI论文700余篇（其中3篇论文的影响因子在10以上），授权专利和软件著作权登记600余件（其中授权发明专利420余件）。