海拉尔铁路办事处隶属于哈尔滨铁路局，即原来的海拉尔铁路分局。建国后铁路部门采用铁路局、铁路分局、站段、车间、工区的级别管理模式，2005年3月18日铁道部部长宣布全全国15个铁路局（含青藏铁路公司）中设有分局的10个铁路局撤销铁路分局，铁路系统开始实行铁路局（集团公司）直接管理站段的管理体制。国15个铁路局（含青藏铁路公司）中设有分局的10个铁路局撤销铁路分局，铁路系统开始实行铁路局（集团公司）直接管理站段的管理体制，并在原有铁路分局的基础上成立铁路办事处，管理当地原铁路分局范围内的各个站段，铁路办事处为铁路局派出机构。

由于精简单位机构，原海拉尔铁路分局管辖范围内的一些单位（如客运段、电务段、机务段、水电段等单位）相继撤销，划归齐齐哈尔等段管理。

管内铁路沿经满洲里、海拉尔、牙克石、扎兰屯、根河、额尔古纳6个市和新巴尔虎左旗、陈巴尔虎旗、鄂温克族自治旗、鄂伦春自治旗。全分局共管辖三条干线（滨洲线、牙林线、伊加线）、三条支线（博林线、伊敏线、朝乌线）、一线国际联运线（满洲里至后贝加尔）和一条联络线（卓山至汇流河），线路总延长2 368.65公里（原伊分局829.928公里），营业里程客运1 405公里、货运1 510公里。管内铁路东起扎兰屯市，与齐齐哈尔铁路办事处管辖交界，西至中俄边境，与俄罗斯后贝加尔铁路局博尔集亚铁路分局交界；牙林线由滨洲线牙克石站北至满归站；伊加线由牙林线伊图里河站至加格达奇站，与齐齐哈尔铁路办事处管辖交界。

哈尔滨铁路局海拉尔车务段主管车站：

滨州铁路呼伦贝尔段：

胪滨站、东壕站、扎赉诺尔西站、湖北站、嵯岗站、豪门站、皇德站、赫尔洪得站、陵丘站、都伦站、完工站、东营站、乌兰丘站、乌固诺尔站、大良站、海拉尔东站、西素木站、伊敏站、西哈站、哈克站、扎泥河站、扎罗木得站、大雁站、海满站、牙克石站、卓山站、小北站、免渡河站、北头河站、乌川站、三根河站、乌努耳站、哈拉沟站、西岭口站、伊列克得站、兴安岭站、新南沟站、博克图站、沟口站、旗山站、雅鲁站、紫沟站、喇嘛山站、巴林站、富林站、南木站、哈拉苏站、三道桥站、卧牛河站、扎兰屯站、高台子站、古里金站、成吉思汗站共52个车站，

博林线：

山泉站、忠工站、卯山站、石门子站、源泉站、北千里站、新绰源站、梨子山站、南千里站、塔尔气站共10个车站

两条铁道线路：滨州线呼伦贝尔段、博林线全线。其中：

满洲里站属一等车站，归属哈尔滨铁路局主管。海拉尔站现归属海拉尔车务段

三等站5个：博克图站、大雁站、免渡河站、扎赉诺尔西站、扎兰屯站、牙克石站

哈尔滨铁路局根河车务段主管车站：

阿里河站、阿龙山站、阿乌尼站、朝原站、朝中站、大其拉哈站、得耳布尔站、甘河站、根河站、哈达站、汇流河站、吉文站、金河站、金林站、喀喇其站、克一河站、库都尔站、岭北站、岭南站、满归站、煤田站、莫尔道嘎站、牧原站、牛耳河站、索图罕站、图里河站、乌尔旗汗站、乌鲁布铁站、新帐房站、岩山站、伊图里河站、原林站

共32个车站，三条铁道线路：牙林线全线、朝乌线全线、伊加线全线