海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室的历史可追溯到1953年，为方宗熙教授所创立的山东大学生物系达尔文教研小组，1983年更名为
山东海洋学院海洋生物遗传育种研究室，1985年成为首批国家教委（现国家教育部）重点开放实验室，2008年获批建设
教育部重点实验室，2011年6月通过验收正式运行。
实验室面向海洋生物遗传学重大科学问题和蓝色种业发展的重大需求，从分子、细胞、个体和群体等多层次开展海洋生物遗传学与种质资源开发
研究。主要研究方向：海洋生物分子遗传学与分子育种、海洋生物细胞遗传学与
细胞工程育种、海洋生物基因组学与进化生物学。
本实验室一直是国家海洋科技研发领域中的一支生力军，在海洋生物的遗传学理论研究与育种技术体系建设取得重大突破。获得国家科技进步二等奖3项，发明奖1项，省部级奖励18项。先后培育出“荣福”海带、“蓬莱红”栉孔扇贝、 “981”龙须菜、“海大金贝”虾夷扇贝、“爱伦湾”海带、“三海”海带、“蓬莱红2号”栉孔扇贝、“2007”龙须菜等海水养殖新品种，支撑了海水养殖业的可持续健康发展。
目前实验室建立了贝类
分子遗传学与育种、鱼类细胞遗传与发育生物学、藻类遗传改良与功能基因组、海洋生物种质资源库等研发平台，设施先进、设备精良。实验室为山东省“泰山学者”特聘教授岗位设立单位，目前已形成一支结构合理、层次均衡、优势突出的学术团队。
现有固定人员25人，其中教授9人，副教授9人，包括山东省
泰山学者特聘教授2人，
国务院特殊津贴获得者2人，教育部新世纪人才4人，专任教师中具有博士学位者100%。