深圳湾出入境边防检查站位于深圳市南山区金湾西二路深港西部通道口岸旅检大楼西北侧约150米。深圳湾出入境边防检查站隶属于
深圳出入境边防检查总站，正处级建制。主要担负着出入境旅客、交通运输工具的边防检查及对口岸限定区域实施警戒管理任务。全站共设9个基层科队。
深圳湾口岸座落于美丽的
深圳湾畔，东与
皇岗口岸向望，西邻
蛇口口岸，与香港
新界仅深圳湾海湾相隔。深港两地由
深圳湾公路大桥相连，连接深圳蛇口与香港元朗，是我国公路干线网中与香港连接的高速公路大桥，也是广东沿江高速公路的咽喉。该口岸于2002年4月开工，是个客货综合性口岸，也是我国第一个实施“一地两检”查验模式的口岸，港方口岸查验区在深方界内。口岸所需用地由填海获得，口岸占地面积为117.9公顷，深方用地76.3公顷，港方用地41.6公顷。
口岸设计车辆流量5.86万辆/日，旅客流量6万人次/日。口岸旅检大楼设计共3层，总建筑面积5.6万平方米。旅客出入境查验通道设计共80条，目前启用40条，出入境各20条。货车出入境检查通道44条，出入境各22条。小车通道38条，其中，出入境各19条（大巴各2条、小车各17条）。
截至2024年12月1日，深圳边检总站深圳湾边检站今年已查验出入境人员超3500万人次，日均客流量10.6万人次，同比去年增长53.8%，单日客流量5次创下口岸复通以来新高，最高达16.5万人次。
2007年5月14日至5月19日，深圳湾站在总站的统一部署和指导下组织全站民警在观澜培训中心进行为期一周，以军事训练和理论学习为主要内容的培训。5月21日至5月28日，深圳湾站根据执勤岗位需求，组织全站民警分批分组到罗湖、皇岗进行跟班实习。5月29日，深圳湾站全体民警正式进驻深圳湾口岸，开始了为期一个多月的岗前培训演练。此阶段的培训主要以日常勤务模拟演练、处突演练为主要内容，通过培训不断提高民警的业务水平和实战能力。尤其是6月23日至7月1日，深圳湾站严密组织全站民警做好口岸看护警卫工作，对深圳湾口岸进行24小时全天候看护，从而圆满完成了“七.一” 口岸开通庆典安全保卫和深圳湾口岸如期顺利开通两项重要任务，赢得了公安部、部六局、总站等各级领导的充分肯定和社会各界的赞扬。