美国34%的亚美混血儿被诊断患有
精神障碍，这一比例在非混血儿亚裔中仅占17%。现代欧亚人是人类和其远亲尼安德特人的混血种人，现代欧亚人基因里存在1.5%到4%的尼安德特人基因（在大脑和睾丸中几乎不作用），两个物种之间的杂交可能只发生了4次。
过敏症、
抑郁症、
帕金森病、
心脏病、
血栓、
高血压、
心脑血管疾病、
脑中风、
糖尿病、
关节炎、
吸烟上瘾、
胆汁性肝硬化、
动脉粥样硬化、
自身免疫性疾病等大量疾病与尼安德特人基因密切相关。
尼安德特人基因的有益作用相比极少。
只要存在一定
基因差异的人群通婚，其后代为混血种人。不同人种皆存在一定基因差异，参考
世界人种基因图谱。2006年，一份在《
自然》杂志上发表的研究结果宣称发现人类差异性基因从0.1%升至10%，同时也遭到了业界质疑。