其祖父
独孤楷周时已拜为西河县公，是
八柱国卫国公
独孤信的爱将，为
隋代周后，又拜为右监门将军，进封汝阳郡公，数岁，迁右卫将军。601年初为原州（治今宁夏固原）总管。
隋炀帝即位，转独孤
楷并州总管 。
其父
独孤彦云，早期随
唐太宗参加
玄武门之变。
武德九年六月四日，
长孙无忌与尉迟敬德、
侯君集、
张公谨、
刘师立、
公孙武达、独孤彦云、
杜君绰、
郑仁泰、
李孟尝等九人，入玄武门讨建成、元吉，平之。独孤彦云是九将中最早牺牲的，在
颉利可汗南下时壮烈牺牲。封幽州
都督、
历阳郡公。
同时，独孤彦云后在颉利可汗与唐对峙中牺牲，《
唐会要·卷六·诸帝公主》中记载
安康公主下嫁独孤谋，与《
新唐书》记载一致，然而《卷二十一》关于
昭陵陪葬人员又记载安康公主驸马
独孤彦云。由于史料中关于这两人记载都很缺乏，所以众说纷纭，很多专家认为独孤谋可能就是独孤彦云（独孤谋字彦云）
独孤谋是独孤家族留下的唯一血脉。他加入唐朝军队，在北伐
东突厥之战中屡建战功。后娶得
安康公主为妻。