甘蔗花叶病主要危害叶片，尤以新叶基部症状最为明显。一般出现黄绿相间不规则的嵌纹、条斑或斑驳，长短大小不一，布满叶片。有时病斑褪绿很明显，形成黄白斑，偶现坏疽之红点。病株叶色较健株浅，生长也缓慢。
病毒粒体线状，大小630～770×13～15(nm)，内含单链RNA，病毒钝化温度53～57℃，稀释限点1000～100000倍，体外存活期27℃为17～24小时，-6℃时可存活27天。该病毒有株系分化，台湾已发现A、B及A+B3个株系。大陆只发现A、D两个株系。株系不同对不同品种致病力有差异。
带毒的蔗种及田间病株是该病主要初侵染源。传毒介体主要是蔗刀和传毒蚜虫，如黍蚜、锈李蚜、丝蚜、黑蚜、玉米叶蚜、蔗蚜、桃蚜等。台湾主要是
禾谷缢管蚜。此外蔗田中的蚂蚁与若蚜一起活动，具间接传病作用。
(1)种植高抗或免疫品种。如闽糖70/611、桂糖11等。(2)选用无病蔗种，挖除病株，重病田停种宿根蔗。(3)适时除草，因许多
禾本科杂草既是该病寄主，又是传毒黍蚜的寄主。避免与玉米、高粱等作物间作、邻作。