持家基因(house-keeping genes),又称管家基因,是指所有细胞中均要稳定表达的一类基因,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的。如
微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与
核糖体蛋白基因等。管家基因是一类始终保持着低水平的
甲基化并且一直处于活性转录状态的基因。
简介
管家
基因表达水平受环境因素影响较小,而且是在个体各个生长阶段的大多数,或几乎全部组织中持续表达,或变化很小,因此常存在于生物细胞核的
常染色质中。它的表达只受启动序列或
启动子与
RNA聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达,因此管家基因常被用于分子技术--多位点
基因分析。一般来说多位点基因分析通常需7个管家
基因位点(
金黄色葡萄球菌),某些时候可能到10个基因位点(致伤弧菌)。
看家基因列表
人类
看家基因列表如下(部分基因,最常用的是ACTB和GAPDH),这是Trends in Gentics文献(Human housekeeping genes are compact)上分析得来的。
*NM_001101 Homo sapiens actin, beta (
ACTB), mRNA6988
*NM_000034 Homo sapiens aldolase A,fructose-bisphosphate (ALDOA), mRNA3425
*NM_002046 Homo sapiens glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPD), mRNA828
*NM_000291 Homo sapiens phosphoglycerate kinase 1 (PGK1), mRNA2727
*NM_005566 Homo sapiens lactate dehydrogenase A (LDHA), mRNA2105
*NM_002954 Homo sapiens ribosomal protein S27a (RPS27A), mRNA4156
*NM_000981 Homo sapiens ribosomal protein L19 (RPL19), mRNA6997
*NM_000975 Homo sapiens ribosomal protein L11 (RPL11), mRNA6060
*NM_007363 Homo sapiens non-POU domain containing, octamer-binding (NONO), mRNA1708
*NM_004309 Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) alpha (ARHGDIA), mRNA1358
*NM_000994 Homo sapiens ribosomal protein L32 (RPL32), mRNA9523
*NM_022551 Homo sapiens ribosomal protein S18 (RPS18), mRNA11261
*NM_007355 Homo sapiens heat shock 90kDa protein 1, beta (HSPCB), mRNA4119