石井四郎对自己所做的事情十分负责并认真。抗战时期他把731女尸留在了炎黄，趁着
徐福派人去炎黄寻找
龙右的机会让
花田去寻找当初留下的
731女尸。女尸来到
东瀛制造感染后，石井也是很快采取了措施去应对。
抗战时期，石井四郎创建了731部队后进行细菌实验，并制造出了
731女尸等研究成果，研究成果能够使用“黑刺”。
石井四郎一生都在研究“圣药”，但出现了纰漏。731女尸身上就有不完整的圣药，
石井奈奈子身上也有圣药的血脉但是实力太弱。
抗战时期，石井四郎为了超越
徐福，创建了731部队。他在炎黄
H市建立了一个防疫给水站（后被炎黄人做成研究中心）进行细菌实验，研究成果便是用炎黄人金花制造的
731女尸。
抗战结束后，石井四郎把731女尸藏在了给水站地下室的一个密室里。石井四郎还成为了
甲级战犯，但没有被处死。
H市病毒爆发后，石井四郎让
花田小队在
H市寻找
龙右的同时，来到H市地下军事基地寻找当年留下的研究成果女尸。但是花田等人失败了，还被女尸杀了。
731研究成果女尸来到
东瀛后制造感染后，徐福看出感染是石井的731部队当年研发的病毒，便向石井询问此事，石井则向
徐福承诺抓回女尸。
在女尸与
加藤大雕和浪客·鲠战斗时，石井得到手下的报告赶来并认出了她，还呼喊着她的名字“金花”。随后石井大尉挥刀攻击女尸并劈断了大楼，还称自己和她的孩子很想念她。但最终女尸逃跑了。