漫画和动漫《魔术快斗》的组织，组织成员都是以动物为代号，别称“动物园”。目的是找到神秘的“生命之石”潘多拉，来实现长生不老的目的。八年前“害死”了天才魔术师黑羽盗一，现在也时刻与第二代怪盗基德黑羽快斗为敌。（与《名侦探柯南》中的黑衣组织并非同一个组织）

《魔术快斗》中的神秘的犯罪团伙，于漫画Vol.3 File.5《蓝色生日》（TV 5）中初登场。

一位神秘首脑雇佣世界各地的杀手，组建成该组织，主要目的是寻找传说中使人长生不老的“命运之石”——“潘多拉”，因此对散落在世界各地的大宝石下手。据说暗杀了因为偷窃珠宝而妨碍了神秘组织行动的第一代怪盗基德（黑羽盗一）。主要登场人物为斯内克（Snake）与“蜘蛛”（Spider，动画原创人物），该组织曾多次与基德交手，但均以失败告终。其实力似乎远远不如可以动用大型军用飞机（柯南M13、M20）以及潜艇（柯南M26）的黑衣组织。

该组织龙套成员大多数身穿褐色制服，而头目级别人物（如斯内克、蜘蛛、胖子头目等）身穿黑色制服。组织大部分成员都戴着黑色礼帽（蜘蛛除外）

漫画中该组织的主要对手主要为黑羽盗一、黑羽快斗、寺井黄之助，而动画版则为黑羽盗一、黑羽快斗、白马探、小泉红子、寺井黄之助等人。

注：青山刚昌已明确表明此神秘组织与《名侦探柯南》中的黑衣组织是两个不同的组织。在“神秘列车”篇后怪盗基德和黑衣组织之间也不会有任何交集。

在哈雷彗星降临地球之前找到神秘的生命之石“潘多拉”，在月光之下照耀，生成“宝石的泪珠”。饮下宝石的泪珠后会实现长生不老的愿望。

所以该组织计划在哈雷彗星到来之前将一个个著名的大宝石找到手，并找出真正的“潘多拉”宝石。因为怪盗基德（黑羽盗一）阻止他们夺取宝石于是就“暗杀”黑羽盗一。现在也处处和怪盗基德（黑羽快斗）作对。

和黑衣组织一样，神秘组织的首脑也被称为“那位先生”。除了BOSS以外，神秘组织在漫画中出场3人，在动画中原创一人。

8年前，神秘组织操纵了第一代怪盗基德黑羽盗一的一场演出（第一版动画为火焰逃脱术，第二版动画疑似为水中逃脱术），众目睽睽之下“杀死”了黑羽盗一。（实际上未死）

漫画File.1&TV1&《1412》TV1，寺井黄之助假扮怪盗基德，意图吸引神秘组织出现。而黑羽快斗见到寺井黄之助，意外得知自己的父亲当年的“死亡”不是意外，而是有人刻意为之，于是毅然决定继承基德的名号，为父亲报仇。

漫画File.19&TV5&《1412》TV2，神秘组织成员斯内克打电话警告怪盗基德（黑羽快斗）不准继续对宝石出手，待基德拿到“蓝色生日”后斯内克率领组织小弟们来到天台上，当着基德的面说他就是黑羽盗一，让快斗明白了眼前的这些人就是杀死自己父亲的凶手。在警告怪盗基德交出宝石后未果后，斯内克开枪“击杀”了怪盗基德，带着宝石回到了分部。

回到分部后其组织的小头目对斯内克等人讲解了组织老大夺取宝石，找到“潘多拉”的计划，却被怪盗基德听到。在发现手上的“蓝色生日”是假的之后，基德扔出真正的“蓝色生日”（被中森银三装上发信器），大批警察赶到。神秘组织不得不提前撤退，分部被警察端掉。

之后，小头目跟BOSS报告，BOSS回复“交给蜘蛛处理。”（《魔术快斗》动画原创剧情）

《魔术快斗》TV7中白马探为了调查神秘组织杀手“蜘蛛”从英国赶回日本，碰巧赶上与怪盗基德对决。在白马探与基德的较量中基德遇到了蜘蛛，陷入蜘蛛的幻境之中，被白马探用水泼醒，蜘蛛利用无人机把白马探吊了起来。随后无人机被基德识破并摧毁，大批警察赶到之际，蜘蛛撤退了。这一切的对决被小泉红子利用水晶球目睹，红子也开始注意蜘蛛与神秘组织。在战斗结束后神秘组织开会，蜘蛛和斯内克以及BOSS说明了“现在的怪盗基德和八年前的不是一个人”的结论，斯内克恍然大悟。BOSS则再次重申，“交给蜘蛛处理。”（《魔术快斗》动画原创剧情）

漫画File.20，在怪盗基德将“绿之梦”送给古畑惠后神秘组织已经确认“绿之梦”不是“潘多拉”，故没有采取行动。BOSS下令监视基德行动的斯内克“久留无益，撤退！”（对应动画删除本集神秘组织戏份）

漫画File.21&TV8&《1412》TV22，神秘组织盯上了魔术团团长朱蒂·霍伯身上的“红色之泪”，但是由于基德发出预告函，中森银三带了大批的警察在这里驻守，神秘组织的杀手假扮成基德的样子引开警察注意力，途中杀手开枪让中森立刻发现不对劲。斯内克想强迫朱蒂交出宝石，被基德捣乱，斯内克和天上飞的杀手撞在了一起，任务失败。

《魔术快斗》TV9中，白马探查清了基德的身份就是黑羽快斗，小泉红子通过水晶球预言发现蜘蛛也会出现，于是假扮基德偷走了宝石。不料半路上被蜘蛛偷袭....随后真正的基德用计暂时击退了蜘蛛，蜘蛛在临走前说出“The nightmare is always by your side.”（噩梦时刻伴随着你）（《魔术快斗》动画原创剧情）

《魔术快斗》TV10中，由于蜘蛛在巴黎表演，白马探于是追着蜘蛛离开日本前往法国，中途给予基德关于怪盗黑猫的提示。（《魔术快斗》动画原创剧情）

File.22&TV11&《1412》TV14中，神秘组织对英格拉姆公国伊莎贝斯女王的“水晶之母”出手，蜘蛛假扮菲利普王子的贴身侍女艾莉丝成功找到了基德，后在斯内克的要求下撤退。（《魔术快斗》动画原创剧情）而斯内克与基德在皇家专列再次交手，失败。

而在《柯南、基德与水晶之母》中在基德与杰卡尔（疑似为斯内克）交手的同时，女狙击手罗斯被江户川柯南识破伪装并用足球放倒。（《名侦探柯南》ova原创剧情）

漫画File.33~File.34&《1412》TV23~24中，怪盗基德即将对决来自拉斯维加斯的神秘怪盗“怪盗乌鸦”。“那位先生”要求斯内克将“午夜寒鸦”夺回。

在斯内克率领神秘组织成员出现后，怪盗乌鸦显现真容...在以闪电般的速度拿走基德的扑克牌枪发射扑克牌后，神秘组织被冻在原地...无奈之下斯内克等人只得把鞋子留在原地逃跑。

怪盗基德：真实身份为高中生黑羽快斗，喜欢魔术，为了替父亲报仇、摧毁潘多拉而与神秘组织为敌。

黑羽盗一：世界闻名的魔术师，第一代怪盗基德。因为阻止神秘组织而被神秘组织“杀死”（未死）

黑羽千影：怪盗淑女，似乎知道神秘组织的计划

寺井黄之助：两代怪盗基德的助手，知道黑羽盗一被神秘组织“杀死”的事情

白马探：来自英国的高中生侦探，蜘蛛的死对头（动画设定），为了追查蜘蛛从英国来到日本

小泉红子：红魔法继承者，神秘的魔女，因为被蜘蛛利用刺杀怪盗基德而和神秘组织结怨

朱蒂·霍伯：霍伯魔术团团长，世界上最大的红宝石“红色之泪”的拥有者，被神秘组织威胁、攻击

伊莎贝斯女王：英格拉姆王国的女王，菲利普王子的母亲，水晶之母的拥有者，被神秘组织攻击

怪盗乌鸦：怪盗基德的对手，疑似为黑羽盗一，帮助怪盗基德对抗神秘组织

《魔术快斗》

《魔术快斗1412》

1.蓝色生日 / Blue Birthday 失败。斯内克“击杀”怪盗基德，结果带回来假货，分部基地被警察端掉。

2.绿之梦 放弃。已经查明不是“潘多拉”，故没有动手。

3.紫色瞳孔的青铜像 未果。蜘蛛没有对宝石下手，直接对付怪盗基德，被白马探阻止。

4.红色之泪 / Red Tear 失败。被怪盗基德成功守护。

5.粉红的蓝宝石 未果。被红子假扮的怪盗基德拿走，最后由快斗还给博物馆。

6.水晶之母 失败。被怪盗基德成功守护。

7.午夜寒鸦 失败。被怪盗基德与怪盗科尔博（疑似为黑羽盗一）一起成功守护。

·首先，两个组织虽然最高首领都叫“那位先生”，都是追求“长生不老”的组织，但是一个是利用现代科技的手段开发药物（APTX4869），一个是信奉神话传说寻找传说的宝石（潘多拉宝石），研究方向不在一个频道上面，所以不是一个组织。

·然后，两个组织代号上面也有区别。黑衣组织成员代号都是酒名，比如说琴酒（Gin）、朗姆（Rum）等，被粉丝称为”酒厂“，而神秘组织成员代号都是动物，比如说斯内克（Snake）、蜘蛛（Spider）等，被粉丝们称为“动物园”，这也对不上。所以从种种细节上看，两个组织不是同一个组织。

·也有人容易把黑衣组织成员龙舌兰和神秘组织成员斯内克搞混，因为二人都是其作品中的“组织成员”，出场时都是穿黑色服装、戴宽边礼帽，都留胡子。所以很容易混淆。