第三次冲击，动画电影《新世纪福音战士 Air/真心为你》中的事件。

主要过程

时间设定是在2016年3月，SEELE和NERV关于人类补完计划的分歧最终演变为“战争”，SEELE借助战略自卫队之手占领了地下都市（Geo Front），并摧毁了NERV本部，然后通过九台EVA量产机以及初号机强行进行了人类补完计划。

首先，进行人类补完计划是SEELE的愿望，补完计划的最终目的是消除人类的心之壁，让人类回归黑之月。而补完的时候则会发生第三次冲击，也就是说发生第三次冲击并不是SEELE的最终目的，它只是伴随着补完计划的进行而发生的，或者说此时的第三次冲击是补完计划的一部分~至于使徒（寄宿者亚当灵魂的渚薰 ）接触亚当（植入碇源渡手中的胚胎）后而引发的第三次冲击，它并不能带来补完计划的最终结果（人类的心之壁消除，回归黑之月），只是单纯的灭亡人类，所以才要消灭使徒，这是进行补完计划的前提~

其实补完的方式不止一种，而我们在旧世纪剧场版EOE中看到的是莉莉丝（肉体+灵魂）+亚当（肉体+灵魂）+9台量产+朗枪+初号机（拥有生命之果和智慧之果）+真嗣的自由意志的这种形式来进行补完计划~也就是亚当和莉莉丝缺一不可~

人类遗传因子与亚当的接触实验引发了第二次冲击，亚当不是初号机，初号机复制自Lilith（但是没有S2机关，与人类接触不会引发冲击，具有同等的战斗力）。

源度把亚当胚胎（被加持从SEELE那偷出来交给元度）植入了自己右手，这是因为亚当的胚胎里含有生命之果，在第三次冲击中的关键（成为神）。

LILITH为执行者，而真嗣则作为“神之子”做出选择，结局是LILITH发出的反A.T力场中和了全人类的A.T力场，引发了第三次冲击，并使全人类化为“LCL之海”，唯有碇真嗣和明日香得以保持完整形态。而“LCL之海”是在人类失去了维系身体的作用力后所化为的没有形态的“生物”。在第十七使徒渚薰的一些提示下，人类被证实为第十八使徒，即为吞食了智慧之果的人类，因为自身的A.T力场微弱而分散成一个个的个体，每个人都拥有一部分智慧之果，第三次冲击即为人类的回归，成为整体的“使徒”。

第3次冲击的具体微观表现是，人会见到自己最想见到的幻想，然后肉体化为LCL，灵魂被Lilith吸收融为一体。