江苏省苏州昆剧院前身为成立于1951年的上海民锋苏剧团，为民间职业剧团，并于1953年落户苏州。2001年11月改团建院，更名为江苏省苏州昆剧院。

江苏省苏州昆剧院前身为成立于1951年的上海民锋苏剧团，为民间职业剧团，并于1953年落户苏州。为了进一步繁荣戏曲事业，更好的发展孕育于苏州的苏剧，昆剧事业，在党的关怀下于1956年10月正式批准为国营性剧团，定名为江苏省苏昆剧团、苏剧昆剧兼演。2006年迎来剧团50周年生日。

2001年5月18日，昆剧被联合国教科文组织列为“人类口述及非物质遗产代表作之一”，作为昆剧发源地的苏州市党政领导和广大民众，对昆剧的“保护、继承、创新、发展”寄以更大的关注和支持。由此，经苏州市委、市府批准，于2001年11月改团建院，更名为江苏省苏州昆剧院。

建院（团）五十年来，先后演出了昆剧《牡丹亭》、《长生殿》、《白兔记》、《钗钏记》、《荆钗记》等和苏剧《花魁记》、《五姑娘》等百台大戏和继承演出了二百余折苏剧、昆剧折子戏。

建院（团）五十年来，相继培养了“继”、“承”、“弘”、“扬”四代昆剧演员。其中尤以著名昆剧艺术家“梅花奖”得主张继青、王芳为佼佼者，更为可喜的是王芳出色塑造了《长生殿》的杨贵妃形象，又于2005年获得中国戏曲梅花奖二度梅殊荣。

改革开放后，剧院（团）先后参加了历届昆剧汇演及第二届、第六届中国艺术节。在文化部举办的“天下第一团”优秀剧目展演、全国昆剧青年演员交流演出、全国昆剧新剧目展演及首届和第二届中国昆剧艺术节和全国昆剧优秀青年评比演出中，共获得二十多项奖励。现有一级演职员10人，二级演职员20人。

剧院多次招待国内外贵宾，并先后出访美国、意大利、日本、新加坡、德国、法国、韩国、中国台湾地区、中国香港地区、中国澳门地区等国家和地区，深获好评。

剧院于2001年10月和昆山市、周庄建立合作关系，在周庄旅游景点——古戏台每天展演昆剧。

江苏省苏州昆剧院坚持“古老的传统样式。纯正的昆剧风貌”之特色。一贯以抢救、继承传统昆剧为己任。并在继承传统的基础上，立志创新，并“抢抓机遇”、积极推进“职业剧院”“经营剧院”建设。2004年，在苏州市政府的大力支持下，剧院和台湾石头股份有限公司合作打造上、中、下三本昆剧《长生殿》，在2004年2月台湾首演，并于2004年、2005年在香港、北京、上海、南京、及上海交通大学演出引起轰动。更引起世人注目的是昆剧院又紧紧抓住机遇，和著名华人作家白先勇等海内外文化菁英诚挚合作，精心打造昆剧青春版《牡丹亭》上、中、下三本全剧。一批青年演员在汪世瑜、张继青等名师悉心培养下，脱颖而出，引起广泛关注，凸现出苏昆事业后继有人的可喜景象。该剧于2004年4月以及5月份相继赴台、港首演，又在澳门、上海、北京、杭州、苏州、佛山、深圳、北大、南大、南开、复旦、同济等地演出最近又赴美国访问演出又一次掀起昆剧的热潮，剧院获得广泛的赞誉和较高的评价。江苏省苏州昆剧院在省、市宣传文化主管部门支持、关怀下，在以品牌项目推动艺术传承、人才培养、剧院建设中作出有益的尝试和显著的进步。

2006年，在国家昆曲艺术抢救、保护和扶持工程资助项目中，由郭启宏编剧，杨小青执导，王芳领衔主演，排演了八场昆剧《西施》，参加第三届昆剧艺术节展评演出。获优秀剧目奖殊荣，这次本院品牌剧目《长生殿》作为初选剧目，参加2005——2006年度江苏省舞台艺术精品工程评审演出，也是2007年1月出访比利时前的一次预演，同时也是纪念本院成立五十周年的庆贺演出。

2019年11月，《国家级非物质文化遗产代表性项目保护单位名单》公布，江苏省苏州昆剧院获得“昆曲”项目保护单位资格。

2022年4月，江苏省苏州昆剧院演员队拟入选2022年苏州市工人先锋号公示（集体）名单。