2011年正式成立农学部并启动研究型学部建设，2012年1月，由
华中农业大学傅廷栋教授等6位中国工程院院士和
中国农业科学院黄三文研究员、
中国农业大学韩振海教授组成的专家组成员，近日出席西南大学研究型学部建设方案专家论证会，通过了方案论证，并提出诸多建设性意见。出席此次论证会的院士除傅廷栋外，还有中国工程院院士、华中农业大学校长邓秀新教授，中国工程院院士、
云南农业大学校长朱有勇教授，中国工程院院士、
吉林农业大学李玉教授，中国工程院院士、
四川农业大学荣廷昭教授，中国工程院院士、西南大学向仲怀教授。
2011年2月，西南大学农学部组建以来，将与重庆市烟草专卖局（公司）合作共建
重庆烟草科学研究所。
目前农学部共有在职教职工245名，其中农学与生物科技学院92名，园艺园林学院99名，植物保护学院54名。共有正高级职称专家42名，副高级专家79名，博士生导师21名。
农学部现拥有国家重点(培育)学科1个(果树学)、重庆市重点一级学科3个(作物学、园艺学和植物保护学);拥有作物学、园艺学和植物保护学3个一级学科博士学位授权点和博士后科研流动站，在站博士后14人。
目前农学部拥有南方山地农业教育部工程研究中心、南方山地园艺学教育部重点实验室(在建)、农业部西南作物遗传改良与育种重点开放实验室、教育部高等学校学科创新引智基地以及13个重庆市重点实验室和工程中心，省部级实验平台数量位列学校各单位第一位。同时拥有西南地区最大的昆虫标本馆，馆藏标本达20余万号，另有植物标本10余万份，藏量居川渝地区前列。
“十一五”期间，三学院共取得科技成果奖励23项，其中，国家科技进步二等奖1项(参加)、省部级一等奖5项，成果数超过学校总获奖数的一半以上。2010年农学部成立以来，申请获准486项各类项目，其中
国家自然基金项目53项，各类项目批准经费达14326万元。项目数量及总经费居学校各单位首位。
农学部现有在校学生3562人，其中普通本科生2828人，硕士研究生651、博士研究生83人。拥有多个人才培养基地，其中包含985
优势学科创新平台1个，教育部人才培养模式创新实验区1个，教育部引智基地1个，教育部“本科质量工程”项目——西南大学农科教合作人才培养基地1个，农业部和教育部农科教合作人才培养基地4个，重庆市
2011协同创新中心1个，为培养创新性人才提供了坚强的保障。
2012年6月农学部进入学校第一批研究型学部学科与科技创新平台建设行列。在四年的建设期内学校投入总经费为4960万元，用于改善学科平台条件、资助学术交流等方面。建筑面积23000平方米的农学大楼今年将破土动工。