病原为瓜类黑腐球壳菌（Didymella bryoniae (Auessw.) Rehm.），属
子囊菌亚门真菌。在
PDA培养基上（25±1）℃黑暗下培养，
菌落背面初为白色，后期变为灰黑色，基生菌丝深褐色；气生菌丝发达，絮状，中间稠密，略隆起，初为白色，老化后为灰白色，不形成子囊座和分生孢子器。
西瓜蔓枯病主要为害
瓜蔓、
叶片和
果实。西瓜整个生育期均可发病，引起叶片、蔓枯死和果实腐烂。子叶受害，病斑初呈水渍状小点，渐扩大为黄褐色或青灰色圆形或不规则形斑，不久扩展至整个子叶，引起子叶枯死。茎部受害，初现水渍状小斑，后迅速向上、下扩展，并可环绕幼茎，引起幼苗枯萎死亡。成株期发病多见于茎蔓基部分支处，病斑初为水渍状，表皮淡黄色，后变灰色至深灰色，其上密生小黑粒点，随病势发展病部渐溢出琥珀色胶状物，干后为赤褐色小硬块，表皮纵裂脱落。潮湿时表皮腐烂，露出维管束，呈麻丝状。茎节部也易受害，产生黄白色病斑，潮湿时软化、变黑，后密生小黑粒点，流出胶状物质。叶部发病多从叶缘开始，产生“V”字形或半圆形黄褐色到深褐色大病斑，多具或明或隐的轮纹，后期产生小黑粒点，病斑易干枯破碎。西瓜果实上发病，初呈油渍状小斑点，后变暗褐色圆形大凹陷斑，表面干烈，内部木栓化，常呈星裂状，后期病斑上密生小黑粒点。叶柄发病产生褐色不规则病斑，表面粗糙，有小黑粒点，下雨后病部腐烂，易折断。
病菌以菌丝体、分生孢子器和子囊座随植物病残体在地表、土壤及附着在架材环境中越冬。春天在适宜的环境条件，病菌释放出分生孢子和子囊孢子，借风、雨及浇水传播蔓延，病菌从伤口侵入或直接侵入，引起植株发病。
发生危害程度与温度、湿度和栽培管理技术关系密切。在10-34℃范围内，病原的替育期随温度升高而缩短，空气相对湿度超过80%以上易发病。多雨的年份发病快流行迅速。瓜类连作，地势低洼，雨后积水，缺肥和生长较弱，发病重，病情发展快。温室和大棚栽培，过度密植，通风不良，湿度过高易发病。
每立方米土用99%
恶霉灵可湿性粉剂1-1.5克，对水1-2千克均匀喷洒在营养土上，充分拌匀后装杯播种。也可用50%
甲霜灵可湿性粉剂8-12克，对细土8-10千克制成药土，上盖下垫，可预防西瓜蔓枯病。
育成苗移栽前3-5天，每亩用25%
苯醚甲环唑乳油15克对水45千克喷雾，或用80%多·福·锌可湿性粉剂60克对水45千克喷雾，或用36%三唑酮·多悬浮剂100克对水45千克喷雾。带药移栽，可减轻西瓜大田前期的发病为害。
发病初期，每亩用80%多·福·锌可湿性粉剂60克+25%
苯醚甲环唑乳油15克+漯效王叶面肥120毫升对水45千克喷雾。也可用25%苯醚甲环唑乳油3000-5000倍液、75%
百菌清可湿性粉剂600倍液、70%
甲基托布津可湿性粉剂800 倍液等喷雾防治，5-7天喷一次，连喷2-3次，效果较好。