含有两个相邻的手性碳原子（见手征性）。自然界尚未发现游离的赤藓糖，D-赤藓糖-4-磷酸酯是
碳水化合物酶促转化的中间体。D-赤藓糖为糖浆状液体，有变旋现象；比旋光度+1°→－14.5°(3天，水，C=11 )。L-赤藓糖也为糖浆状液体，有甜味，+11.5°→+ 30.5°（长期平衡，水，C=3)。D-或L-赤藓糖均不为酵母所发酵。D-赤藓糖一般由
D-阿拉伯糖酸钙经氧化制得；L-赤藓糖可由
L-阿拉伯糖酸钙氧化制得。含有两个相邻的手性碳原子的有机化合物，如相当于赤藓糖的手性碳原子的构型，则称该化合物为赤构型。