辉河发源于大兴安岭中部西北侧的丛山密林中，由二十几条小河汇集于乌拉吉呼，折向西北缓缓流入呼伦贝尔草原，把大草原分为两部分。其左侧被称为巴尔虎草原，右侧则是鄂温克草原。

辉河是伊敏河一级支流。在内蒙古自治区东北部。源出鄂温克族自治旗南部，大兴安岭山脉三角山峰西北麓，海拔1321米。西北流折向东北流，穿行新宝力格东沼泽地，在巴彦塔拉达斡尔民族乡北侧注入伊敏河。全长437公里（另说336公里），流域面积11470平方公里，多年平均年径流量1.47亿立方米。流域地势，南部高，东北部低，海拔高程711～1321米。河道蜿蜒曲折，中下游孕育了大面积湿地沼泽。

辉河流域水草丰美，有大量珍贵的水鸟。沿着河流两岸还有大片的芦苇。辉河河道开阔平坦，河水弯弯曲曲流至宝力格东又折向东北，汇入伊敏河。辉河水坝距河口14公里，属于鄂温克族自治旗锡尼河西苏木(乡)境内。北距海拉尔市33公里。

2004年辉河湿地被纳入国家级自然保护区，名称为辉河国家级自然保护区。如今保护区里的水鸟和芦苇因得到妥善保护也有些好转。辉河自然保护区60%的湿地为芦苇湿地。