郑亿年，字长卿，开封（今河南省开封市）人，活跃于两宋之际。名门子弟出身，秦桧的姻亲。于北宋徽宗时中进士，靖康之难后被金军俘虏，后供职于伪齐政权。金国取消伪齐后将郑亿年送至南宋，其后成为秦桧党的成员之一。秦桧死后，郑亿年也被贬官至江西。

郑亿年，字长卿，开封（今属河南）人。郑亿年是郑居中之次子，而郑居中是宋徽宗郑皇后（显肃皇后）的族亲，作为外戚而得宠。此外，秦桧为王珪之子王仲山的女婿，而郑居中的妻子是王珪的女儿王氏；秦桧养子秦熺又娶了郑亿年长兄郑修年的女儿；郑居中之女郑氏嫁给了秦桧的妻兄王唤，而秦熺正是王唤的私生子。因为错综复杂的姻亲关系，所以郑亿年与秦桧两人的关系很好。

大观元年（1107年），郑居中任同知枢密院。按照当时的惯例，作为宰执之子的郑亿年成为宣义郎，于政和六年（1116年）又升直秘阁。

郑亿年于政和七年（1117年）进士（《宋会要辑稿》选举一之一四）。随后，郑亿年任秘书少监。

政和八年（1118年）九月，臣僚上疏请求罢免秘书省不合格之官员数十人，其中包括郑亿年。随后，其余人等皆被罢免送至吏部，唯有郑亿年改任秘阁修撰、提点上清宝箓宫。靖康年间，郑亿年担任提举亳州明道宫。

靖康二年（1127年），开封陷落，郑氏一族举家南迁到平江府昆山县。建炎三年（1129年），郑亿年又逃至衢州避乱。建炎四年（1130年）正月，完颜兀术率领大军南侵，二月“搜山检海”结束，兀术退兵。此时衢州发生兵变，郑亿年为叛军所俘，并被叛军交给金军（也有说是在明州山间便为金兵所擒的）。

同年五月，金太宗册封刘豫为伪齐皇帝，同时刘豫任命郑亿年为伪齐礼部侍郎（也有说法称此时郑亿年为伪工部侍郎，或先后为伪吏部侍郎、户部尚书，或是伪吏部兼户部侍郎的）。绍兴二年（1132年）四月，伪齐迁都开封，郑亿年任伪资政殿学士、伪开封府尹，后又升任伪尚书右丞。

其家属都在南宋。绍兴二年，其妻韩氏在台州去世。

绍兴七年（1137年），金熙宗废除伪齐。绍兴八年（1138年）十二月，宋金议和，金国割让河南、陕西。在完颜挞懒主持下，郑亿年同众多伪齐官员一道归于南宋的管辖。

绍兴九年三月，郑亿年回到宋朝，上表待罪，并称在开封获得宋朝祖宗诸后御容五十余轴。朝廷下旨召其至行在。郑亿年在前往杭州途中经过常州，常州知州王缙当面诘问并羞辱郑亿年，使其惭愧不已。后来秦桧从亿年处得知此事，罢免了王缙的知州职位，将其贬为提举台州崇道观。

到杭州后，秦桧打算任命郑亿年为显谟阁直学士、提举醴泉观，并参与朝会。参知政事李光得知后于高宗榻前当面指责，迫使秦桧放弃。绍兴九年十二月，李光辞职。绍兴十年（1140年）正月，郑亿年被任命为资政殿学士、提举醴泉观，位视执政，引发广大非议。时任右正言陈渊上奏反对将郑亿年官复原职，但因为此时给事中、舍人、台谏大都是秦桧一党，所以郑亿年得以恢复在伪朝中的职位，而陈渊也被罢免了言官职位。

绍兴和议前，郑亿年作为投降派为和议奔走疾呼。绍兴十年五月，金军撕毁和议，大举南侵。同月，郑亿年请求一个外地宫观的职位，于是改任提举亳州明道宫，离开行在。

绍兴十二年五月，郑亿年受召回到行在；六月，郑亿年又被授予提举醴泉观兼侍读的职位。当时，完颜兀术向宋国索取了张中孚、张中彦、郑亿年及一些供职于金国的陕西、河南籍官员的亲属，其中只有郑亿年最终留在南宋。同年七月十三日，郑亿年兼任永固陵攒宫复按使、武功大夫、荣州刺史，与万俟卨、宋唐卿、李珪等人共同负责为徽宗、郑皇后、邢皇后等人修建陵寝，于同年十一月修葺完毕。同年十月，郑亿年升任资政殿大学士提举临安府洞霄宫，并赐田二十顷。这段时期，郑亿年虽然身份尊贵，但并没有实际秉政。

绍兴二十五年（1155年）十月，秦桧病亡，宋高宗开始清除朝中秦桧余党。同年十二月，郑亿年被贬为建武军节度副使，送往南安军（今江西大余）安置，最终死于抚州。