重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，是国家儿童区域医疗中心、国家一流本科专业建设单位、国家临床医学研究中心，国家发改委优质医疗资源输出单位，全国文明单位。医院现有渝中院区和两江院区两个院区，共有编制床位2480张，平均开放2200张。2022年医院门急诊量307.55万人次（去除核酸），住院量9.93万人次，全年互联网医院诊治11.51万人次，外埠病人比例近40%。医院现有教职员工3900余名，博士生导师46名，高级职称专家314名、享受政府特殊津贴专家15名。

重庆医科大学附属儿童医院最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授予点、博士后流动站，是首批儿科学国家重点学科、教育部重点实验室、国家级国际科技合作示范基地、国家级继续医学教育基地、国家级教学团队、国家精品课程、国家食品药品监督管理局药物临床试验机构、全国住院医师规范化培训示范基地、国家级儿童早期发展示范基地、国家干细胞临床研究备案机构。

重庆医科大学附属儿童医院是中华医学会儿科学分会常委单位、中华预防医学会儿童保健分会副主任委员单位，是《中华儿科杂志》、《中华小儿外科杂志》、《中国实用儿科杂志》、《临床小儿外科杂志》等杂志副总编、副主编单位及国内10余家杂志副总编和编委单位；是国家规划教材《儿科学》第六版主编和第七、八版副主编单位。

重庆医科大学附属儿童医院是全国规模最大的儿科医师培养基地，承担着临床医学本科、硕士、博士、博士后教育及临床进修、医师规范化培训等教学任务。年招收本科、硕士、博士研究生400-500名，进修生及规范化培训人员400-500名。拥有先进、齐备的教学设备和临床技能训练室供学员学习和模拟训练。

重庆医科大学附属儿童医院于2019年正式获批国家临床医学研究中心、是发育与疾病教育部重点实验室，“营养与生长发育、感染与免疫、先天畸形综合矫治、儿童慢性疾病研究与防控”为临床和基础研究主攻方向。拥有5个重庆市重点实验室和3个工程中心。小儿临床免疫、儿童保健、儿童呼吸病学、泌尿外科和新生儿病学是重庆市医学重点学科。

2023年12月7日，四川省宜宾市人民政府、重庆医科大学附属儿童医院共建国家区域医疗中心签约暨重庆医科大学附属儿童医院宜宾医院揭牌仪式在宜宾市举行。

2021年度重庆医科大学附属儿童医院儿内科、儿外科均居全国儿童医院第三位。在2022年度中国医院科技量值(STEM)排行榜中，医院位居全国儿童专科医院第三位，有18个学科荣登前100位榜单；中国医院2018-2022年五年总科技量值（ASTEM）中，位列全国儿童专科医院第三。

2019年11月，由复旦大学医院管理研究所发布的“中国医院排行榜”中，重庆医科大学附属儿童医院的小儿内科和小儿外科均排名全国第三位。2019年12月，由中国医学科学院发布的2018年度中国医院科技量值与中国医学院校科技量值（STEM）排行榜中，重庆医科大学附属儿童医院儿科学排名全国第三位。

2020年8月，由中国医学科学院发布的2019年度中国医院科技量值与中国医学院校科技量值（STEM）排行榜中，重庆医科大学附属儿童医院儿科学排名全国第二位。

2021年3月，国家卫生健康委员会公布《2019年度全国三级公立医院绩效考核国家监测分析有关情况通报》，重庆医科大学附属儿童医院在全国儿童医院中跃居第3位，上升1位，等级A，CMI值跃居全国儿童医院第2位。

重庆医科大学附属儿童医院专业设置齐全，有42个临床和医技科室，有重症医学、小儿呼吸、新生儿、小儿外科、临床护理、心血管内科、肾脏内科、神经内科共8个国家临床重点专科。罕见病（PID）诊治技术、肝移植技术、脐带血造血干细胞治疗技术、先天性心脏病介入诊疗技术、介入肺科学技术、儿童癫痫手术、微创外科手术、极低出生体重儿综合救治及HIFU治疗儿童实体肿瘤等技术均达国家一流水平。

2015年2月，获得中央精神文明建设指导委员会授予的“第四届全国文明单位”荣誉称号

2019年12月，建立重庆市首个国家临床医学研究中心（儿童健康与疾病）

2020年1月，重庆儿童医院的儿科学专业入选国家首批一流本科专业建设点

2020年6月，重庆儿童医院麻醉科、放射科、超声医学科获批“国家级住院医师规范化培训专业基地”

2020年10月，入选重庆市卫生健康委公布的可开展新冠病毒核酸检测医疗机构名单。

2020年9月，成为重庆市医学资源样本库联盟成员。

2020年9月，重庆儿童医院住培儿科专业基地荣膺国家首批“住院医师规范化培训重点专业基地”

2020年11月，重医附属儿童医院成为首批“中国康复医学会重症康复专科培训基地” ，是全国儿童医院唯一获批单位

2021年8月，重庆医科大学附属儿童医院两江院区普外新生儿外科被命名为“第20届全国青年文明号“。

2022年4月，荣获重庆五一劳动奖状。

医院现有教职员工3900余名，博士生导师46名，高级职称专家314名、享受政府特殊津贴专家15名。

李秋：院长，全国人大代表，教授，博士生导师，国务院政府特殊津贴获得者，重庆市首席专家工作室领衔专家。长期从事儿童肾小球疾病发病机制及肾损害慢性化进程机制研究。

何大维：副院长，主任医师，教授，医学博士，博士生导师。重庆市学术技术带头人，重庆市巴渝学者特聘教授，中华医学会小儿外科学分会委员，中华医学会小儿外科学会内镜学组委员，中国医师协会小儿外科分会委员，中国医师协会小儿外科住院医师规范化培训委员会委员。掌握应用微创外科技术诊治小儿泌尿生殖畸形，尤其是腹腔镜下治疗肾积水的水平处于国内先进、达到国际水平；对尿道下裂手术治疗有独到见解及具有提高一期治愈率的丰富经验；融合国内外治疗儿童肿瘤的新技术，在不降低治愈率的基础上，保留患病器官结构功能治疗儿童肿瘤，提高患儿生存质量。