重庆市油菜工程技术研究中心以市场为导向，以科技成果转化为目标，主要从事油菜基础理论、新品种选育与推广和油料制品的高效加工利用等科技成果的研究与转化，实现科研、推广和加工一条龙产业化的良性发展，以提高我国油菜产品的国际竞争力。中心主任和中心学术委员会主任由重庆市“振兴重庆增光贡献奖”和全国“五一”劳动奖章获得者、新世纪百千万人才工程国家级人选、重庆市首批学术技术带头人、博士生导师李加纳教授担任。中心下设综合管理办公室、技术开发部和成果推广部。技术开发部由遗传育种研究室、细胞工程研究室、生理生化研究室和分子育种研究室组成，成果推广部由油菜制种基地、油脂加工基地、质量控制中心和销售公司组成。中心现有固定研究人员27人，其中博士生导师2人；高级职称13人，中级职称9人，初级职称5人；博士8人，硕士13人。中心常年在读博士研究生10余人，硕士研究生20余人。
中心主要开展油菜遗传、生理生化、细胞工程、分子标记筛选、基因克隆和转基因等基础、应用基础研究和新品种选育、高产栽培技术、油脂加工利用等应用研究，同时进行新品种试验示范、推广和种子生产销售等开发研究，具有很强的研发能力和创新能力。
中心所属北碚研究基地、垫江制种基地和渝北加工基地，拥有现代种子加工设备、进口大型适温冷榨设备、
PCR扩增仪、DNA序列测定仪、蛋白质双向电泳系统、高压液相色谱仪、
气相色谱仪、
凯氏定氮仪、近红外分析仪、低温冷冻离心机、大型可控温室、近万平米网室、100亩试验基地等先进仪器设备和设施。
中心曾获省部级科技进步奖5项，自然科学奖1项，丰收奖1项，先后育成油菜新品种11个，在全国各地推广应用2500多万亩，成果转化新增产值10多亿元。2004年以来，中心承担了国家973计划、863计划、948计划和
国家自然科学基金重点项目等国家和省市级项目共18项，年均科研经费200万元以上。中心选育的杂交油菜新品种“渝黄2号”通过国家农作物品种审定委员会审定，选育的杂交油菜新品种“渝黄3号”、“渝油20”和“渝油21”通过重庆市农作物品种审定委员会审定，“甘蓝型黄籽油菜粒色形成机理及调控技术研究”2005年6月通过重庆市科委组织的以官春云院士为组长的专家组鉴定，结论为达到同类研究的国际领先水平，“甘蓝型油菜含油量调控方法”和“甘蓝型黄籽油菜粒色调控方法”获国家发明专利，近五年在国内外学术刊物发表研究论文100余篇。
目前，中心新建装修了350平米的实验室，价值500多万元的仪器设备均已到位并投入运转；完成了52亩试验用地规范改造，修建田间水泥硬化便道3000多米、主排水沟3500米、隔离护栏1080米；新建了育种基地科研楼600多平方米，晒场1200平方米。位于垫江的制种基地总面积达到5000亩（沙坪基地3000亩、高峰基地2000亩），种子年生产能力达到250吨。位于渝北现代农业园区的加工示范基地采用国外先进设备建设的低温冷榨菜油生产线，完成投资7000万元，年生产能力达到10万吨。
中心与加拿大、澳大利亚、美国、德国等和华中农业大学、湖南农业大学、中国农科院油料作物研究所等建立了良好的合作关系，先后有10余名研究人员和研究生进行合作研究和交流。