作为
桑河畔的贸易中心和港口城市，雅罗斯瓦夫得到了快速发展，在
16世纪和
17世纪到达了繁荣的顶点。
西里西亚与鲁滕尼亚和
格但斯克与匈牙利之间的贸易路线均穿越雅罗斯瓦夫，每年的圣母升天日都有大量来自
西班牙、
英国、
芬兰、
亚美尼亚和
波斯的商人汇聚这里。
1574年，雅罗斯瓦夫建立了一所
耶稣会学院。
1590年代，来自
奥斯曼帝国的
鞑靼人占领了雅罗斯瓦夫周边地区，虽然他们一直无法攻破城市的防御，但却严重削弱了城市的经济实力。而1620年代暴发的
腺鼠疫和
1655年到
1660年之间发生的
波兰-瑞典战争进一步影响到雅罗斯瓦夫的重要性。在
1700年-
1721年的
大北方战争中，雅罗斯瓦夫被
俄罗斯帝国、萨克森和
瑞典帝国的军队轮番侵占，城市实力进一步被削弱。