《本草经集注》是南北朝梁代
陶弘景创作的古代医学著作，全本共七卷。尽管原书已失传，但敦煌石室中仍保存有其残本。同时，《证类本草》与《本草纲目》也保留了原书的主要内容。
陶弘景(456年—536年)，字通明，自号华阳隐居，谥贞白先生，
丹阳秣陵(今江苏南京)人。南朝齐、梁时道教学者、炼丹家、
医药学家。
南北朝梁代陶弘景所编著于（约公元480年—498年前）。陶氏认为《本经》自“魏晋以来，
吴普、
李当之等更复损益，或五百九十五，或四百四十一，或三百一十九，或三品混揉，冷热交错，草石不分，虫兽无辨，且所主治，互有得失，医家不能备见”等问题，于是给予整理、作注。又从《
名医别录》中选取365种药与《
本经》合编，用红、黑二色分别写《本经》与《别录》的内容，名之为《本草经集注》。本书原书已佚，现仅存有敦煌石室所藏的残本。但原书中的主要内容，还可从《
证类本草》和《
本草纲目》之中见到。
《本草经集注》共7卷，载药730种，分玉石、草木、
虫兽、果、菜、
米食、有名未用7类，这是药物分类的一个进步，但每类之中仍分三品。又创“诸病通用药”，如治风通用药有防风、防己、
秦艽、芎劳等，治黄疽通用药有茵陈、柜子、紫草等。这对临床选择用药，有很大的助益。对药物的产地、
采集时间。炮制、用量、服法、药品真伪等与疗效的关系，均有所论述。本书问世后有很大的影响，唐代的《
新修本草》就是在此书基础上补充修订而成的。
南朝
博物学家陶弘景把前人积累的经验和知识搜集起来，结合自己的实践经验，进行了另一次总结，整理成《本草经集注》一书。共得药物七百三十种，书中，他首创按药物的自然属性和治疗属性分类的新方法。首先把七百多种药分为草、木、
米食、虫兽、玉石、果菜和有名未用等七类，这种
分类方法后来成了我国古代药物分类的
标准方法，在以后的一千多年间一直被沿用，并加以发展。
陶弘景还首创治疗性能对药物进行分类的方法，例如，祛风的药物有防风、
秦艽、防己、独活等，就归在同一类。这种分类方法便于治疗参考，对医药的发展业起到了
促进作用。