以中国高等植物为核心,采集、集成、整合现有的各相关
数据库,目标是建设一个符合国际和国家标准、有严格质量控制与管理、具有完整性和权威性、具国际领先地位的中国植物物种信息数据库，由植物学学科积累深厚和专业数据库资源丰富的
中科院昆明植物研究所、中科院植物所、中科院武汉植物园和中科院华南植物园联合建设，充分运用
植物学、
植物资源学和植物区系地理学等有关理论、方法和手段，在顶层设计的基础上，依靠植物学专家（参考型数据库），共涉及高等植物约300余科3400余属31000余种，其数据内容主要包括：植物物种的标准名称、基本信息、系统分类学信息、生态信息、生理生化性状描述信息、生境与分布信息、文献信息、图谱图片、微结构和染色体等信息
中国植物图谱数据库主要收录我国境内已知植物物种的各种属性信息及相关图形、图像、视频信息，并按三大体系进行建设。一是按照植物物种的分类体系进行建设，如中国
菊科植物图谱数据库、中国
禾本科植物图谱数据库、中国兰科植物图谱数据库等；二是按照某些特殊类群植物的独有特征分门别类地建设，如中国特有种子植物图谱数据库、中国有毒植物图谱数据库、中国饲用植物图谱数据库等；三是按照我国某些关键地区和地域的特征进行建设，如华中药用植物数据库、神农架经济植物数据库等、神农架药用植物数据库等。
中国植物图谱数据库将收录我国境内全部的已知植物物种，每个植物物种除提供属性信息外，还提供黑白线描图和大量的彩色照片。全部信息都已实现网上数据共享，并提供了功能强大的查询检索服务及逐条记录浏览、多记录浏览等功能，在此基础上，还将逐步开放中国植物物种计算机在线辅助鉴定服务。
如果用户需要了解某种特定植物的信息，或需要了解具有某种特性的植物有哪些，也可以检索查询。植物物种的种中文名、种拉丁名、种别名、形态特征、产地分布、用途等重要信息都是可以检索查询的。
生物多样性为人类的生存与发展提供了极其重要的生活物质和重要的生存环境，近年来我国就生物多样性的保护开展了大量的研究，中国植物图谱数据库的建立为我国植物多样性的保护研究提供了极大的支持。先后支持了国家973 项目的水生植物研究专题、世界自然基金会的湖北省湿地植被调查研究、
国家自然科学基金项目、湖北省科技公关项目等，都取得了较好的应用效果。
国家战略植物资源的迁地保育是我院
知识创新工程重大方向之一，在实施过程中需要查阅大量有关植物物种的资料。每引种一个物种，都涉及编制引种计划、查找物种分布，鉴定物种性状到引种栽培诸多的环节，而每一个环节都要查找大量资料，如果手工翻阅文献资料，工作量是巨大的。中国植物图谱数据库的建立给国家战略植物资源的迁地保育建设也提供了极大的便利。
中国植物图谱数据库将在现有的基础上逐步完善我国境内已知植物物种的各种信息，特别是逐步补全和丰富植物物种主要器官，如花、果、叶、根、茎、果实、种子等的彩色照片信息和生境视频信息。
此外，中国植物图谱数据库还将建设更多的特殊类群植物数据子库，如能源植物、古老孑遗植物、
外来入侵植物、观赏植物、园林绿化植物、经济植物、药用植物、食用植物、纤维植物、热带植物、
沙漠植物、海洋植物等，可逐步形成一个独特的特殊类群植物数据库体系。