1984年国家
教育部发出通知，要求所有“文革”以前建立的高等学校，着手组织力量编写校史。全国高校系统纷纷启动
校史编写工作。在编写过程中，各校深感需要就编写中的共性问题进行交流、探讨，便于1988年9月商议召开“高校校史研讨会”，得到
厦门大学的大力支持。同年，十几所院校在该校召开了第一届高校校史研讨会，并成立了“高等学校校史研究会”，在
中国高等教育学会备案，接受
中国高等教育学会指导。学会的主要工作内容是研究、探讨各校校史编写中的共性问题，为决策部门提供校史信息咨询。1995年5月28日经
中国高等教育学会批准，正式成为分支机构。2002年2月重新登记后，仍作为中国高教学会的分支机构，并更名为“中国高等教育学会高校校史研究专业委员会”。2003年12月高等教育学会发文正式核准名称为“
中国高等教育学会校史研究分会”。 研究会成立之后，建立了管理机构，制定了章程，每两年召开一次学术研讨会，交流校史编研的经验，探讨工作中的具体问题。迄今已分别在
厦门大学、
西安交通大学、
北京师范大学、四川（联合）大学、
上海交通大学、
山西大学、
重庆大学、
湖南大学召开了八次研讨会，并出版了《学府史论》一书，收集了前五次研讨会部分会员单位的学术论文。 研究会现有会员单位33个，都是建校时间较长，校史研究工作在国内有一定影响的高等院校。会长由
北京大学原党委书记
王学珍担任，副会长为
南开大学副校长陈洪，下设秘书长单位，现秘书长单位为华东师范大学，秘书长由华东师范大学校史党史办公室主任朱小怡担任。研究会下设学术委员会，由
南开大学梁吉生教授任主任、
南京大学王运来教授及
复旦大学龚向群副研究馆员任副主任。研究会另设14个常务理事单位。