吴三桂既死，其孙吴世璠犹据滇、黔，命佛伦总理粮饷，通
镇远运道，旋兼理四川粮饷。事平，迁
刑部侍郎。寻迁
左都御史，擢工部尚书，转刑、户两部。
先是下河工程，靳辅与
按察使于成龙议不协，命佛伦偕侍郎
熊一潇等勘议。佛伦受明珠指使，议如靳辅之言，为漕运总督慕天颜所弹劾。御史陆祖修劾佛伦袒护靳辅，且言：“九卿会议时，尚书科尔坤等按照佛伦意图，尚书张玉书、左都御史
徐乾学言兴屯所占民田应还之民，科尔坤置之不闻。他九卿或不得见只字。”上怒，下部严议。及郭琇弹劾明珠，指佛伦为明珠党羽，因解佛伦之任。召靳辅等廷对，佛伦乃奏停屯田，并淘汰前所设官员。部议夺佛伦官，上命留佐领，旋授内务府总管。
出为山东巡抚，疏请均
赋役，令绅民一体应役，诏嘉其实心任事。初，潍县知县朱敦厚以赃私为山东巡抚钱鎯所举发，乞徐乾学请於钱鎯，获免，且内擢主事。至是事发，下佛伦鞫实，徐乾学坐夺官职。佛伦又劾郭琇知吴江县时，尝侵公帑，其父郭景昌故名尔标，乃明朝御史黄宗昌奴才，坐贼党诛，郭琇改父名冒封典，当追夺名声。徐乾学故附明珠，后相失，或传郭琇疏徐乾学实主之，故佛伦以是报。寻擢川陕总督，入为礼部尚书。三十八年，授
文渊阁大学士。三十九年，郭琇入觐，讼父受诬。上诘佛伦，自承不实，当夺官职，援赦得免。未几，以原品休致。旋卒。