解放战争后期，为适应战略决战的需要，1948年11月1日，中央军委发出通令，对
中国人民解放军的组织编制、番号作了统一规定，其中军区分为一级军区（即
大军区）、二级军区、三级军区和军分区，实行四级军区体制。各级军区均以所在区域的地区或地点命名。
1949年10月中华人民共和国成立时，
中央人民政府人民革命军事委员会直辖5个一级军区，即东北军区、华北军区、华东军区、华中军区、西北军区。1950年1月，华中军区改称中南军区；2月，西南军区成立。至1950年7月，全国共有东北、华北、华东、中南、西南、西北六大军区。
1955年2月11日，
国务院和
国防部根据中共中央局、中央分局的设置情况，根据中共中央和中央军委对全国战略区的重新划分，决定将全国的六大军区，即东北军区、华北军区、西北军区、华东军区、中南军区和西南军区，改划为十二个大军区。
1948年1月，
东北民主联军改称东北人民解放军，分为东北军区和
东北野战军，
林彪任军区司令员兼政治委员，辽沈战役结束后，林彪、
罗荣桓率东北野战军入关作战，野战军机关与军区机关分离。东北军区机关驻沈阳，
高岗任军区司令员兼政治委员。东北军区为中国人民志愿军提供后勤保障，全力支援了抗美援朝战争。
1948年5月20日，晋察冀军区与晋冀鲁豫军区合并组成华北军区，
聂荣臻任司令员，
薄一波任政治委员，
徐向前任第一副司令员。
1947年2月初，华东地区的人民解放军统一整编，撤销新四军兼华中军区、华中野战军，山东野战军和山东军区番号，成立华东军区和
华东野战军。华东军区由
陈毅任司令员，
饶漱石任政治委员。1949年6月，华东军区机关与第三野战军机关合并（保留各自番号），统一指挥野战军和地方部队，军区机关驻南京。
1949年5月，第四野战军领导机关在河南开封与中原军区机关合并，组成第四野战军兼华中军区，林彪任司令员，罗荣桓任第一政治委员，
邓子恢任第二政治委员，1950年1月，根据中共中央军委1949年12月2日的决定，第四野战军兼华中军区改称第四野战军兼中南军区，1952年6月，中南军区领导机关移驻广州市；同时撤销华南军区，其机关一部组成广东武装工作部，连同广西、海南军区直接归中南军区领导。林彪任中南军区司令员，
叶剑英任副司令员、代司令员，罗荣桓、邓子恢、
谭政任政治委员。
1949年2月1日，陕甘宁晋绥联防军区改称西北军区，
贺龙任司令员，
习仲勋任政治委员。1949年11月，贺龙率西北军区机关一部和第18兵团等部进军四川，后并入西南军区。11月30日，中共中央军委决定，西北军区与第一野战军合并，称第一野战军暨西北军区，
彭德怀任司令员，习仲勋任政治委员，军区机关驻西安。
1950年2月9日，中共中央军委任命西南军区领导成员，成立西南军区。以第二野战军机关为基础，同率领第18兵团入川的西北军区机关一部合并，组成第二野战军暨西南军区领导机关。贺龙任军区司令员，
邓小平任政治委员，军区机关驻重庆，后移驻成都。