内蒙古农牧学院成立于1952年，是内蒙古自治区创办最早的本科高等学校。其前身为内蒙古畜牧兽医学院，当时的中央人民政府主席毛泽东同志签署任命了第一任院长。1958年更名为内蒙古农牧学院，同年，内蒙古自治区成立内蒙古林学院。1999年经自治区人民政府决定，教育部批准，内蒙古农牧学院和内蒙古林学院合并组建内蒙古农业大学。学校是国家西部大开发重点支持建设的院校，也是国家大学生文化素质教育基地院校之一，是国家草业学会会长单位。学校下设的职业技术学院是全国高等职业技术教育示范院校建设单位。

学院经过40多年的建设与发展，已发展成为一所以农牧业学科为主，专业配置较全的综合性学校。设有11个系、3院、2部、2基地、1中心。现有在校生5000余人，教职工1571人，其中教授76人，副教授238人，讲师328人。学院为博士学位授予单位，“动物营养学”、“草原科学”为博士学位授权学科专业，现有硕士学位授权点20个。兽医病理学、动物营养与饲料加工、草原科学、农业水土工程等学科为自治区级重点学科。 学院创办以来，为国家和自治区培养各级各类专业人才27000余人 ，其中研究生351人。年平均承担课题总数、年平均获奖课题总数及科研总经费连续数年在内蒙古自治区高校中名列第一。

1999年4月，原内蒙古农牧学院和原内蒙古林学院合并组建后，学校的办学实力和规模进一步提高。学校具有农、理、工、经、管、文等6个学科门类，25个二级学科的多科性大学。形成了以本科教育为主，具有研究生教育、本科教育、专科教育、成人教育、高等职业教育的多层次、多形式的办学体系。建校50年来，共为社会培养各类人才5万余名。

学校现有动物科学与医学学院、林学院、农学院、生态环境学院、机电工程学院、水利与土木工程学院、林业工程学院、经济管理学院、食品科学与工程学院、生物工程学院、计算机与信息工程学院、人文社会科学学院、成人教育学院、职业技术学院等14个学院、1个外国语言系和1个基础课部、1个体育教学部。1个国家一级学科（畜牧学）、1个国家重点学科（草业科学）、自治区级重点学科8个，农业部重点学科1个，1个博士后科研流动站（畜牧学）、有9个二级学科开展博士学位授权工作，有28个硕士学位授权点。有42个本科专业。有蒙汉双语授课专业13个。学校所设专业基本覆盖了自治区经济建设和社会发展所需的学科门类。在校生1.6万余人。其中，硕士和博士研究生758人。

学校总面积910.31公顷，校舍建筑面积41.489万平方米、学生宿舍8万平方米。标准田径场（馆）4个。图书馆建筑面积2.50万平方米，藏书117.68万册。学校教学仪器设备总值1.06亿元。

国家自然科学基金项目57项，总经费1136万元。据统计，自然科学基金项目名列全国农业院校第5位，项目受资助率列全国高校第37位。