该故事就是始于江南翠竹镇上，镇上有户孟家其女孟丽君（
叶璇饰）聪明绝顶，喜作男装打扮瞒其父孟士元（
卢海鹏饰）在外求学，结交朋友。机缘巧合下男装的丽君结识微服下江南的王孙铁穆耳（
马德钟饰）及忠直少年皇甫少华（
林峯饰），三人从此结下不解缘。而丽君早被某人笛声打动，误以为吹笛人是铁穆耳，由此芳心暗许。天意弄人，丽君父亲却将丽君许配世交皇甫敬之子皇甫少华（因少华之前化了名，丽君不知二者为同一人）。
朝廷命官刘捷之子刘奎璧（
张松枝饰）一次机缘巧合，错认了与丽君情同姊妹的近身侍婢苏映雪（
杨怡饰）为孟家小姐，仗势求亲，孟士元无计可施，遂以比箭定亲事。丽君苦无对策，只好约铁穆耳，欲坦白一切，可惜铁穆耳父亲病危，必须立刻返京，遂将丽君约会之事交托少华，丽君大为失望，斥走少华。为了自己终身幸福，丽君决意与侍婢荣兰（
刘玉翠饰）离家暂避。丽君四处闯荡，遇上一班自称梁山后人的乌合之众，期间竟又遇上被刘奎璧陷害落难的少华，丽君知道眼前人就是自己的未婚夫皇甫少华，因对少华无好感，只好继续隐瞒自己真正身份。
另一方面，铁穆耳回朝只能见父亲真金最后一面，皇上忽必烈把太子之位传于铁穆耳，令觊觎皇位之九王爷（
廖启智饰）对铁诸多针对，铁陷于烦恼之中，幸得青梅竹马的阔真郡主加以劝慰。丽君于往京师路上，巧遇乐不思蜀的太皇太后（
罗兰饰），双方成为忘年之交。铁穆耳南下找寻离宫远去的太皇太后，又遇上正颇感失意的丽君，二人相处过程中，真正燃起爱火。丽君回复女儿身打扮决向铁表白，可惜凑巧铁要火速回京，铁唯有再次找少华替自己赴君约。结果被少华得知君女儿身份，君对铁再次失约亦只有再一次的失望，二人遂联袂上京。
过程中，丽君发现少华种种好处，得知少华是真正的“吹笛人”，爱情火花，一触即发。而少华亦爱上君，但因有婚约，只好收心底。少华为了逃避已暗暗爱上丽君的事实，不辞而别，留书出走，说自己要守诺，忠贞于发妻丽君，丽君甚是感动。铁穆耳初登帝位，决开科考试，招揽人才，并恩准汉人参与；丽君冒名顶替参加科举望能一举高中，替其父伸冤。丽君高中状元，获悉铁穆耳乃是当今天子，铁多番试探丽君身份，皆不得要领，遂设计令丽君被九王爷招为女婿，一场扰攘，知道皇爷女儿竟是失散多时的映雪。
铁穆耳出巡期间，九王爷派来的杀手亦同时到来，幸得少华及时相救。华救驾有功，封为将军得以入宫，与丽君相处机会更多，碍于认为丽君和铁穆耳存有微妙关系而不敢表白。然而丽君却开始分清少华就是自己至爱。偶然机会下丽君的真正身份被人发现，九王爷遂以此胁迫铁穆耳，要他选择放弃江山，又或是忍心孟丽君身份被揭，要负上欺君杀头之罪。
《再生缘》是TVB改编古典名著中最具好感的一部，也是全外景在内地拍摄的一部古装电视剧。孟丽君的故事虽然已经在内地家喻户晓，但拍的最好看的当属这部《再生缘》。整个电视剧始终贯穿着古典优雅的气质，无论音乐、画面和服装都充满诗意（新浪娱乐评）。
戏说历史题材名著向来是无线的强项，这回，无线又将清代才女
陈端生的《再生缘》拿来戏说了一把，雌雄莫辨、为父申冤、宫廷之争，这部由新人担纲的剧集，故事曲折，轻松幽默、人物活泼生动。
林峰作为无线力捧的新人，在《
寻秦记》《
美味情缘》中表演天赋得到了观众的肯定。在《再生缘》中，林峰将一个憨厚、痴情、正直的皇甫少华把握得恰到好处。特别是将对误以为是男子的丽君，爱与礼的挣扎的矛盾心理刻画得恰如其分。此次叶璇努力想否定对自己走红是因为其讨好的相貌的怀疑，出演聪明过人、好强争胜却又刁蛮任性的孟丽君，但要她成为无线的当家花旦看来还需要假以时日。这对黑与白，憨厚与刁蛮的组合，在剧中冲突不断，令人忍俊不禁。出演铁穆耳的马德钟算是熟面孔，此次也委以重任，虽然出演不讨好的角色，但表演起来很出彩。
改编当属成功之作，在两位主人公性格特点上做足功夫，二人冲突斗气不断，并在他们身边增添了几位谐趣的人物，使得该剧轻松有余却不牵强。更有意思的是，该剧还添上马可·波罗，不能不说匠心独运。
此次无线选择了风景秀丽的江南水乡作为《再生缘》的外景地，既适应了剧情的需要，烘托了剧情的发展，又让观众在欣赏曲折剧情之时，能同时欣赏江南美景，着实是献给观众的一道美味的视觉大餐，没准翠竹镇又能掀起一个旅游小高潮（南方网评）。