王莽末年，全国都分崩离析了，冯鲂便召聚
宾客，收养豪杰，建造营垒壕堑，等待形势发展决定将来的归宿。这时湖阳大姓虞都尉据城拥兵而反，他以前就跟同县申屠季家有仇，就杀了申屠季之兄，并想灭了申屠家族。申屠季逃亡归附于冯鲂，冯鲂带着申屠季回营垒，路上遇到了虞都尉的堂弟虞长卿，长卿想抓走申屠季。冯鲂怒斥长卿说：“我与申屠季虽不是老相识，但他遭难了来投奔我，自当用生命来担保，你有什么说的？”就带着申屠季安全地回来了。申屠季感谢说：“蒙您大恩得以保全，无以为报，家中的牛马财物，我愿全部献给您。”冯鲂气忿地说：“我年迈的父母和幼弱的弟弟都在贼人占据的城里，今日援手，尚且无所顾及，说什么牛马财产？”申屠季惭愧不敢再吭声。冯鲂从此受地方上所崇敬，所以能据守营垒保全自己。
当时天下未定，而四方之士拥兵自强称王称帝的特别多，只有冯鲂仅求自卫，而且很有心计谋略。光武帝听说后很赞赏，建武三年，征聘他来到自己的临时住地，在南宫的云台见了面，任他为虞县县令。冯鲂为政敢于杀伐决断，很有威信。改任郏县令。
建武十三年，改任魏郡太守。建武二十七年，业绩考核为高等，因而入朝代替赵憙为
太仆。中元元年，随光武帝东封岱宗，执行卫尉职责。回京后，代
张纯为司空，赐爵
关内侯。中元二年，光武帝去世，派冯鲂持节砌造原陵，改封为阳邑乡侯，食俸三百五十户。明帝永平四年，因为负责陇西太守邓融的考核而犯听任奸吏之罪被罢免，削去爵位封地。永平六年，明帝巡视鲁，再次执行卫尉职责。永平七年，冯鲂代替阴嵩任
执金吾。
冯鲂性格威严而公正，在职常进忠言，多被采用。永平十四年，下诏恢复其爵位封地。永平十五年，明帝东巡各地，让冯鲂留守宿卫南宫。章帝建初三年，以老病请求退职，章帝同意。这年冬天，被推举为五更，特下诏冯鲂参与朝贺，站在
列侯的班位中。元和二年，冯鲂去世，享年八十六岁。