南京地铁13号线是南京地铁线网中一条东西走向的过江线路，一期线路西起国际健康社区站，向东下穿长江后进入主城，东至高桥门站，计划于2030年以前建成通车，标志色未定，该地铁线路仍在规划中。

地铁13号线途经浦口区、鼓楼区、玄武区、秦淮区和江宁区，线路西起沿山大道站，向东下穿长江后进入主城，东至七桥瓮公园站，此外在2020年，七桥瓮公园站至江宁段用地控制竞争性磋商公告发布。

地铁13号线全长36.4千米，共设置19座车站，列车采用6节编组列车。

2015年江北新区获批后，南京地铁13号线调整为过江线路，江北段线路设置站点为江北市民中心站、江北商务区站、国际健康社区站、万寿路站、兴隆路站、南京工业大学站、康安路站、河滨公园站、文德路站、凤凰山站、沿山大道站等站点。

2020年，南京地铁13号线列入长江干线过江通道布局规划（2020-2035年）。同年，七桥瓮公园-江宁段用地控制规划项目竞争性磋商公告发布。

2021年8月，南京地铁13号线原明故宫站由于文物保护改到解放路上的解放路站。

2021年11月，南京地铁13号线江北商务区站槽壁加固首根桩基开钻，标志着南京地铁13号线迎来重要进展。

过江通道建设，有力促进了长江南北两岸往来交流，有效支撑了沿江地区城镇体系建设，实现了过江通道与生态环境保护、防洪安全、航运安全和谐发展。

但与我国经济社会发展和长江经济带高质量发展要求相比，过江通道规划建设仍存在一些亟待解决的矛盾和问题。一是，过江通道总量偏少，部分地区远距离绕行过江、横向渡运干扰航运等现象仍然比较严重，增加了物流成本，影响了航运安全；二是，部分过江通道负荷较重，重庆、武汉、南京等特大城市和主要城镇化地区过江通道日益拥堵，对南北两岸人员物资交流产生较大影响；三是，资源集约节约利用水平不高，部分单功能通道毗邻修建，通道、岸线和土地资源开发利用仍显粗放。

未来一个时期是建设现代化经济体系、推动长江经济带高质量发展的重要时期。坚持共抓大保护、不搞大开发，坚定不移走生态优先、绿色发展之路，对过江通道布局提出新的更高要求。保护和修复长江生态环境，要求过江通道建设充分考虑资源环境承载能力，与长江生态环境保护、防洪安全和谐发展；完善全国综合交通运输网络和推进长江经济带新型城镇化建设，要求优化过江通道布局，畅通南北干线运输大通道和城市群内外通道，提高对综合交通运输网络的保障能力；提升长江黄金水道功能，要求过江通道建设与长江航运发展相协调，保证长江通航安全顺畅。