学院具有土木工程一级学科
博士后流动站，土木工程一级学科博士点，土木材料与工程博士点，土木工程、
管理科学与工程一级学科硕士点，
建筑与土木工程领域、工程管理、项目管理等专业学位点。具有土木工程、工程管理、
建筑节能技术与工程3个本科专业。土木工程、工程管理专业于2001年首次通过了专业评估，2006年顺利通过了第一次专业复评，均为江苏省首批特色专业。
土木工程专业是国家特色专业建设点、国家
卓越工程师教育培养计划试点专业。
结构工程学科为原建设部重点学科。
学院下设建筑工程系、桥梁工程系、工程管理系、房地产经营管理系、建筑节能工程系、工程图学中心、土木工程试验教学中心等7个系级单位。设有工程抗震研究中心、先进工程复合材料研究中心、建筑结构研究所、新型钢结构研究所、工程力学研究所、生命线工程研究所、天诚不动产研究所、项目管理研究所等研究机构。拥有
江苏省土木工程与防灾减灾重点实验室，
江苏省绿色建筑工程技术研究中心，江苏省土木工程试验教学示范中心。
学院目前在校本科生1800余名，
全日制研究生近600名，工程硕士近200名。学院现有教职工100人，其中顾问及双聘院士4人，
国家自然科学基金委杰出青年基金（海外）获得者1名；省部级优秀工作者3人，江苏省有突出贡献的中青年专家1人，江苏省教学名师1人，江苏省333人才计划获得者4名，江苏省“六大”高峰人才7人，江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人和优秀青年骨干教师6人，江苏省双创博士1名；南京工业大学“工大才俊”2人。国家外专局高端外籍专家2名，形成了老中青相结合、学历层次较高、学缘结构和知识结构较为合理的师资队伍。
为适应国家大规模建设的需要，10年8月，原土木工程学院部分学科成立了交通学院和测绘学院，其余和工程管理联合组建了新的土木工程学院。在近百年的办学历程中，学院为社会输送了2万余名毕业生，得到了社会各界的普遍欢迎和高度评价，已建成包括
学士、硕士、博士、博士后在内的完整的人才培养体系。学院获得了包括国家科技进步二等奖，江苏省科学技术一等奖、二等奖，中国公路学会科技进步一等奖，中国产学研合作创新成果一等奖、中国专利奖在内的多项奖励。
学院紧密结合国家建设需要开展科学研究和科技服务，在结构抗震减震、绿色建筑与建筑节能、钢结构及组合结构、
复合材料结构、工程复合木结构、桥梁工程、工程管理、房地产经营等方面已形成了特色，完成了一批有重要影响的重大项目，获得了包括国家科技进步二等奖，江苏省科技进步一等奖、二等奖，黑龙江省科技进步一等奖在内的多项科技奖励。
学院正在积极抢抓机遇，面向国家重大战略需求和区域经济社会发展需要，全面推进各项事业建设，力争在“十二五”期间实现新的跨越式发展，建成教学、科研、科技服务协调发展的创新创业型学院。
2010年8月26日为进一步优化学科布局，加快有特色
高水平大学建设，更好地服务区域经济和社会发展需求，经
南京工业大学校党委常委会研究决定：
在原土木工程学院
勘查技术与工程、交通工程、
城市地下空间工程等本科专业基础上新组建交通学院，
测绘工程、
地理信息系统等本科专业基础上新组建测绘学院，原管理科学与工程学院工程管理等本科专业并入新的土木工程学院。