台湾镇，前期以预防民变的消极性军事力量为主，此情形直至台湾
建省之后才改变。
台湾镇总兵受台湾道（建省前）及
福建台湾巡抚（建省后）节制，初期统辖镇标中营兼辖
台湾北路协、
台湾水师协二协、台湾城守营与台湾南路营等营，依照1728年的《台湾府疆域图》所示，澎湖水师营2017名、台湾水师营2532名、台湾镇本部连同标中营2633名、北路营898名和南路营898名；驻台官兵合计8978名。
1733年，澎湖水师营改制为
澎湖水师协，其后又略有增减。而一般而言，掌管兵力约于10000名至15000名之间。所分配方式，约如
乾隆年间
奏章所奏：“台湾澎湖水陆兵丁一万二千一百七十六名。除水师兵四千一百六十三名外，南北两路共兵八千零十三名。