建村至明万历元年（1573年），属东莞县；明万历元年至清朝，属新安县。1914年，属宝安县。中华人民共和国成立之初，属宝安县松岗、沙井、新桥、雍睦、凤凰联乡；1951年，属宝安县第四区涌边乡；1958年10月，属超美公社；1959年，属沙井公社后亭大队；1979年1月，属深圳市沙井公社；1981年10月，属深圳市宝安县沙井公社；1983年7月，属宝安县沙井区步涌乡；1986年10月，属沙井镇步涌行政村；1987年，属沙井镇后亭行政村；1993年1月，属深圳市宝安区沙井镇；2004年，属沙井街道后亭社区。
传统经济以农业为主，种植水稻、花生、玉米、香蕉、龙眼、荔枝，饲养猪、鸭、鸡等。改革开放后，村民主要收入来源为房屋出租、集体经济分红，2015年人均分红达6 万元。
2015年末，户籍人口401人，其中男性189人，女性212人；80岁以上11人，最年长者101岁（男）；实际在村人口342人；海外留学1人。非户籍外来人口达4.5万人。祖籍该村的香港同胞约1000人。
村民主要有陈姓和徐姓。徐氏家族在中华人民共和国成立前从岗头村迁至此地，成为后亭村第二大姓氏。陈氏家族于南宋末年从福建莆田迁移至广东潮州，后又从潮州迁移至此地，其后代在后亭村繁衍生息，因莆田有村名为后亭，为了纪念故居，故取名后亭村。陈姓居民是归德（今沙井）陈氏一支，俗称驸马房。
后亭村由于实行旧村改造，传统民居已不存在。原有陈氏大宗祠也被拆除，于2016年下半年在原址重建。内存楹联“六龙怀念姻亲旧；五马追思世泽长”，匾额“源远流长”，均书于南宋。
该村陈氏每年
清明和
重阳去新桥祖坟祭祖。普通人家的年俗基本与沙井附近村落（除了客家人和疍家人）大同小异。
村中特色农产品有后亭油鸭（腊鸭）和花鱼制品。特色传统食品有
炒米饼、
煎堆和
茶果。
宝安大道、新和大道和沙松路经过该村。1960年通电，1980年通自来水，1983年实现全村村道水泥硬底化，1985年通电话，1999年通互联网。村内小学有北亭实验学校，设9个年级，27个班，2015年，在校学生1200人，教职工150人。有爱德幼儿园，在园幼儿293人，教职工45人。其他文体设施有篮球场、后亭社区居民文娱室、社区图书室，图书室藏书1000册。