国清寺，位于江苏南通如东县城掘港的西南，己有一千多年的历史。是庙就少不了烧香拜佛的，国清寺也不例外。每天，寺内总是有不少人或为先辈做佛法事，或祈求佛祖保佑，国清寺的历史与如东掘港的成陆几乎相等。唐朝初年，一道捍海围堤把掘港与海滩分开，国清寺便带着人们对太平盛世的期盼应运而建。
从唐到宋元，国清寺饱受战火之乱，至明清虽然多次重修，但仍在上世纪六十年代被夷为平地。现在的国清寺是从1991年由如东县、南通市两级政府批准，准予落实宗教政策开始筹建。
国清大殿内供奉的是
三世佛：释家牟尼居中，右尊为西方极乐世界的
阿弥陀佛，左尊为
东方琉璃世界的琉璃光佛。药师佛救死扶伤，阿弥陀佛接引众生，与其它寺院中释家牟尼两侧侍者是
阿难和
迦叶有所不同。国清寺最珍贵的当属念佛堂供奉的白玉千手观音。这尊
缅甸国赠送的玉观音由一块整体的
缅甸玉石雕刻而成，玉质细腻，高三点八米，重四吨。这样造型的玉观音在全国也是罕见的。睡下来的释家牟尼佛、
卧佛那种玉佛很多，象国清寺这种千手观音玉佛，是唯独少见的，可以说在全国国清寺是第一尊。
史料记载，如东的佛教源于
东汉。掘港国清寺与中国佛教八小名山之一的浙江天台山的国清寺同宗同法系，均属于
天台宗。浙江的国清寺为隋
开皇十八年（公元598年）由佛教天台宗开山祖师智顗所建，智者法系的第十祖、天台山修禅寺座主行满大师在唐
元和年间（公元806——820年）来到如东历时十四年按照
天台山国清寺的建筑风格创建了掘港国清寺。
掘港国清寺在五代、宋、元年间，屡遭兵燹之损，直至明
万历九年（公元1581年），可良等募化重建，并立碑为记。后经清、民国两代多次重修增建，古寺已具规模，庄严雄伟，结构精致，别具一格。
1960年7月，掘港国清寺被列为省级文物保护单位，可好景不长，1968年底，
大雄宝殿和天王殿在“
文化大革命”中被全部拆除（注：藏经楼已在
解放战争中被拆除），就这样，千年古刹荡然无存。
20世纪90年代初（1991年），适逢盛世，掘港国清寺异地重建，由已故
中国佛教协会会长
赵朴初先生亲题寺名。经过十余载辛勤耕耘，如今的国清寺再现昔日光辉。
古寺还是中日友好的见证。唐
开成年间，日本高僧
圆仁随第13批遣唐使西渡求法，来到掘港国清寺，住宿寺内半月有余。圆仁后来所写的《入唐求法巡礼行记》中，对掘港国清寺有详细记述。在世界旅游文化宝库里，圆仁的《入唐求法巡礼行记》，与中国唐
玄奘的《
大唐西域记》、意大利旅行家
马可·波罗2017年1月20日，
江苏省宗教事务局发布《关于认定南京灵谷寺等13家五星级宗教活动场所的决定》（苏宗发〔2017〕5号），如东县国清寺被认定为第三批江苏省五星级宗教活动场所。