张亚平，1965年出生于云南昭通，分子进化生物学和保护遗传学家，中国科学院院士，发展中国家科学院院士，云南大学名誉校长，第七届中国人与生物圈国家委员会主席，曾任中国科学院副院长、党组成员，中国科学院昆明动物研究所所长。

1965年5月，张亚平出生于云南省昭通市的一个普通知识分子家庭，父母毕业于昆明理工大学从事水利、水电的地质勘测工作。

1982年，由于对动物非常感兴趣，加上高中的生物和化学两门课的高考成绩较好，张亚平报考了上海复旦大学生物系，并顺利考上。

1986年7月，从复旦大学毕业后，报考了中国科学院昆明动物研究所细胞进化学专家施立明的研究生，回到家乡云南，进入昆明市郊的“细胞与分子进化开放研究实验室”，从事动物遗传学研究，开始探索线粒体DNA（mtDNA）这一新的研究领域。

1991年7月，获得博士学位后，留在了中国科学院昆明动物研究所工作，担任助理研究员（1992年8月）。

1992年8月，经老师施立明推荐，前往美国圣地亚哥濒危动物繁殖中心（CRES）分子遗传实验室，进行博士后研究工作，跟随导师Ryder教授继续进行动物的分子进化与遗传多样性的研究（1995年8月）。

1994年，导师施立明因病逝世前写信给张亚平，希望他能回国接手细胞与分子进化开放研究实验室，他回昆明悼念施立明后考虑到回国工作的科研条件和仪器设备等问题，拜访时任中国科学院院长的周光召院士并获得他的支持。

1995年，结束了在美国的工作，回到中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室，担任研究员、博士生导师、主任（时年30岁）。同年获得第二届国家杰出青年科学基金资助，先后获得80万元的经费，项目结束后，被纳入了中国科学院百人计划，又获得80万的经费。

1996年7月，出任中国科学院昆明动物研究所副所长（2005年3月）。同年被评为云南省十大杰出青年。

1999年7月，担任云南省畜禽分子生物学重点实验室主任。

2002年6月，获得第三届国际“生物多样性领导奖”，是获此殊荣的第一位亚洲学者。

2003年，当选为中国科学院院士（时年38岁），隶属于。

2004年7月23日，获得生物科学创新奖。

2005年3月，出任中国科学院昆明动物研究所所长；同年获得云南省科学技术突出贡献奖。

2007年11月，当选为发展中国家科学院院士；11月担任中国科学院昆明动物研究所“遗传资源与进化”国家重点实验室主任。

2008年4月，当选为云南省科学技术协会第七届委员会主席。

2009年7月，被聘为昆明学院名誉院长。

2012年1月—2024年7月，任中国科学院副院长、党组成员。

张亚平从事灵长类、食肉类等一系列动物类群的研究，澄清了这些类群系统与演化中的一些重要问题。推动了国际生命条形码计划和国际“千犬基因组计划”。同时通过推动中国科学院西南家猪分子育种基地的建设将畜禽进化基因组的研究成果应用于家猪分子育种实践并进行产业转化与推广。

张亚平在建立具有国际影响的人群和动物DNA库的基础上，主要从分子水平研究生物多样性的演化及机制，澄清了灵长类、食肉类、两栖爬行类等动物类群系统与演化中的一些重要问题。揭示了东亚人群进化的一些规律和一些民族的演化历程。系统地研究了野生动物和家养动物的遗传多样性，发现遗传多样性贫乏与物种濒危之间没有必然的对应关系；确定了家犬的东亚起源，证明东亚是家养动物驯化的重要区域。对自然选择和人工选择作用下基因组进化的研究，揭示了一些重要的动物适应进化和畜禽经济性状形成的遗传机制。

截至2017年，张亚平先后主持云南省自然科学基金、国家自然科学基金、中国科学院战略先导专项、农业部转基因重大专项等20余项。获国家自然科学二等奖、云南省自然科学一等奖等国家和省部级科技奖励20余项。

承担项目

成果奖励

截至2017年，张亚平在《Nature》《Science》《Nature Genetics》《Proc. Natl. Acad. Sci. USA》《Am J Hum Genet》《Mol Biol Evol》等SCI刊物发表论文200多篇。

代表论文

Wang MS, Otecko NO, Wang S, Wu DD, Yang MM, Xu Y, Murphy RW, Peng MS*, Zhang YP*. An evolutionary genomic perspective on the breeding of dwarf chickens. Molecular Biology and Evolution, 2017, 34:3081-3088. IF14.558

Wang MS, Zeng Y, Wang X, Nie WH, Wang JH, Su WT, Otecko NO, Xiong ZJ, Wang S, Qu KX, Yan SQ, Yang MM, Wang W, Dong Y*, Wu DD*, Zhang YP*. Draft genome of the gayal, Bos frontalis. Giga science, 2017, 6(11):1-7. IF10.644

Zeng L, Ming C, Li Y, Su LY, Su YH, Otecko NO, Liu HQ, Wang MS, Yao YG, Li HP, Wu DD*, Zhang YP*. Rapid evolution of genes involved in learning and energy metabolism for domestication of the laboratory rat. Molecular Biology and Evolution, 2017, 34:3148-3153. IF14.558

Li Y, Wang MS, Otecko NO, Wang W, Shi P, Wu DD*, Zhang YP*. Hypoxia potentially promotes Tibetan longevity. Cell Research, 2017, 27(2):302-305. IF12.393

Li HP, Xiang-Yu JG, Dai GY, Gu ZL, Ming C, Yang ZF, Ryder OA, Li WH*, Fu YX*, Zhang YP*. Large numbers of vertebrates began rapid population decline in the late 19th century. PNAS. 2016, 113:14079-14084.

Shen QK, Sulaiman X, Yao YG, Peng MS*, Zhang YP*. Was ADH1B under Selection in European Populations? Am J Hum Genet. 2016, 99:1217-1219.

Wang GD, Zhai WW, Yang HC, Wang L, Zhong L, Liu YH, Fan RX, Yin TT, Zhu CL, Poyarkov AD, Irwin DM, Hytonen MK, Lohi H, Wu CI, Savolainen P, and Zhang YP*. Out of southern East Asia: the natural history of domestic dogs across the world. Cell Research. 2016,26:21-33.

Wang GD, Peng MS, Yang HC, Savolainen P, Zhang YP*. Questioning the evidence for a Central Asian domestication origin of dogs. PNAS. 2016, 113:E2554-E2555.

Wang GD, Zhai WW, Yang HC, Wang L, Zhong L, Liu YH, Fan RX, Yin TT, Zhu CL, Poyarkov AD, Irwin DM, Hytönen MK, Hannes Lohi H, Wu CI, Savolainen P*, Zhang YP*. Out of southern East Asia: the natural history of domestic dogs across the world. Cell Research, 2016, 26:21-33.

Peng MS, Shi NN, Yao YG, Zhang YP*. Caveats about interpretation of ancient chicken mtDNAs from northern China. PNAS, 2015, 112:E1970-E1971.

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Liu J, Wang XP, Cho S, Lim BK, Irwin DM, Ryder OA, Zhang YP*, Yu L*. Evolutionary and Functional Novelty of Pancreatic Ribonuclease: a Study of Musteloidea (order Carnivora). Scientific Reports, 2014, 4.

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Wang GD, Zhai WW, Yang HC, Fan RX, Cao X, Zhong L, Wang L, Liu F, Gao Y, Lv XM, Irwin DM, Savolainen P, Wu CI*, Zhang YP*. The genomics of selection in dogs and the parallel evolution between dogs and humans. Nature Communications, 2013,4:1860.

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Zhao M, Kong QP, Wang HW, Peng MS, Xie XD, Wang WZ, Jiayang, Duan JG, Cai MC, Zhao SN, Cidanpingcuo, Tu YQ, Wu SF, Yao YG, Bandelt HJ, Zhang YP*: Mitochondrial genome evidence reveals successful Late Paleolithic settlement on the Tibetan Plateau. PNAS，2009, 106(50): 21230-21235.

张亚平与美国、日本等国的多个实验室有长期的合作关系，并已联合招收培养了一批国际、国内的博士、硕士研究生，与来自全国各地的访问学者广泛交流。他的学生中有两人获全国百篇优秀博士论文奖，有3人获中科院院长奖特别奖。2001年，他带领的研究团队入选国家自然科学基金委首批试点资助的15个创新研究群体，在启动的前三年获得360万的支持。

2024年7月31日，根据国务院、中共中央组织部有关通知，免去张亚平同志中国科学院副院长、党组成员职务。

张亚平在生物多样性研究领域，做出了突出贡献。（2002年生物多样性领导奖评）

张亚平的研究和对人才的培养，促进了中国分子进化和遗传多样性研究的发展，进入生物多样性国际研究的前沿。（《中华英才》杂志评）