微生物工程是生物技术的基础和重要组成部分，是生物技术产业化的重要环节。通过本课程的学习，使学生掌握微生物产品生产工艺的基本理论，能进行发酵工厂的工艺设计和解决产品生产过程中出现的主要问题，并为从事生物新产品和新工艺的研究与开发打好应有的理论基础。一般而言，微生物工程可分培养基制备、无菌空气供应、菌种及种子扩大培养、发酵培养、发酵产品下加工过程和微生物过程废弃物处理等六部分。其中发酵培养反映了
微生物发酵生产的水平，是微生物工程的核心部分；培养基制备、无菌空气供应和菌种扩大培养是发酵生产的基础；发酵产品下游加工过程是发酵生产的保证；而发酵废弃物的综合利用和处理是实现发酵工业可持续发展所必不可缺的重要环节。本书第二、三、四、五章为发酵生产的基础部分，第六、七、八章为发酵生产的核心部分，由此构成本书的基本内容；本书第九章、十章扼要介绍发酵产品的下游加工过程和发酵废弃物的利用和处理(清洁生产)，详细内容请读者参阅《
生物工业下游技术》和《发酵工业废水处理》等书籍；最后，在本书第十一章讨论微生物过程的经济问题。