新疆医科大学第二附属医院建于1954年，位于
新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市，是一所集医疗、教学、科研、康复、预防、保健于一体的省级综合型
三级甲等医院。
前身为1954年建立的“新疆军区生产建设兵团第一医院”，1975年更名“新疆维吾尔自治区第二人民医院”，1978年更名“新疆医学院第二附属医院”，1998年更名“新疆医科大学第二附属医院”，2002年挂牌“新疆医科大学第二临床医学院”。医院占地面积26亩，总建筑面积103447.61平方米，编制床位数800张、设置临床科室60个、医技科室14个、教研室15个。3个社区卫生服务中心含新疆医科大学校医院（
河马泉新区社区卫生服务中心）和南湖南、南湖北
社区卫生服务中心。
医院现有1个国家临床重点专科-
神经内科，13个自治区临床重点专科，5个院内重点学科，6个院内培育学科，1个国家
博士后科研工作站；14个专业获批国家级
住院医师规范化培训基地；1个自治区神经系统疾病研究重点实验室；14个学科具有博士培养资质；25个学科具有硕士培养资质，是国家药物临床试验机构（GCP），现拥有国家神经系统疾病临床医学研究中心(新疆分中心)等5个国家级医疗中心；新疆神经系统疾病临床医学研究中心等4个自治区级医疗中心；新疆神经脑科临床诊疗中心等4个校级医疗中心。神经疾病区域医疗中心已被国家发改委列为“辅导类”项目、自治区列为重点项目。
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