林孝恂（？－1914年），字伯颖，福建闽县（今福州）人。光绪十五年（1889年）己丑科考取二甲进士，授翰林院编修，历任浙江海宁、孝丰、仁和、石门、杭州等地方官员。

光绪年间，林孝恂的家境逐渐式微。年轻的林孝恂以西席谋生。但林孝恂聪颖过人，勤奋好学。

光绪十五年（1889年），林孝恂中己丑科考取二甲111名进士，被授翰林院编修一职。

光绪二十五年（1899年）至三十一年（1905年）间，林孝恂三任石门知县。林孝恂在石门县任期内，鼓励农桑，兴办教育，奖拔寒门学子，士林德之。

光绪二十八年（1902年），林孝恂改传贻书院为石门县学堂，实开创新学之始。

清亡后，林孝恂客居沪上，投股商务印书馆以助力现代出版事业。

民国三年（1914年），林孝恂携孙女林徽因移居北京前王公厂，与长子林长民同住，仅三月，即因病去世。

鼓励新学

光绪二十八年（1902年），林孝恂开设石门县学堂。林孝恂十分开明，能接受西方思想。他为学具有务实倾向，谙熟医籍，即其例也。对后代教育亦具新观念，不分男女，一视同仁，私塾设置课程，国学四书五经，新学天文地理，皆延聘名流启蒙，甚至聘请外籍师资教学英、日语，兼收并蓄，理念先进。

在“秋瑾墓地风波”中，浙江巡抚增韫向时任杭州仁和县令林孝恂打听徐自华的事。林孝恂在石门做了6年知县，对徐家颇有好感，他的答复是：徐自华妇人之仁，物伤其类，徐蕴华是女孩子，少不懂事，盲目附从。林孝恂轻轻地把事揭过了。

林孝恂为孙女林徽因取名“林徽音”，是根据一种“ 男楚辞，女诗经 ”说法。林孝恂从《诗经·大雅》“大姒嗣徽音，则百斯男”之句，给孙女取名“徽音”。“大姒”即太姒，传说她品德贤淑。林孝恂希望孙女像大姒那样拥有美好的品德。但这仅仅是寄托了林孝恂的一重期望，林孝恂还有一重期望——他希望接下来添几个孙子 。虽然林孝恂思想开明，但骨子深处还是传统的认为多子多孙，才是家族兴旺的表现。“大姒嗣徽音，则百斯男”，前一句赞美大姒的美好品行，后一句赞美文王子嗣众多。林孝恂给孙女取名“林徽音”，包含着他的两重期望： 既期望孙女拥有美好品德，又希望林家多子多孙。

夫人游氏，喜读书，工书法，相夫教子，为贤内助。

四弟林孝扬。

长子林长民。