1952年，著名水文学家刘光文教授等创建了我国第一个水文专业，并于1955年招收研究生，是我国第一批培养研究生的学科点。1981年首批获得学士、硕士和博士学位授予权。1988年被评为国家重点学科。1991年获世界银行贷款“中国重点学科发展项目”资助，1993年建成水资源开发利用国家专业实验室。1996年列入“九五”“211工程”重点学科建设项目。1997年，
联合国教科文组织通过专门议案，在我校设立UNESCO国际水文水资源及环境培训与研究中心。2001年，批准设立水资源开发教育部重点实验室，2002年再次被评为国家重点学科，2002年列入“九五”“211工程”重点建设项目。
多年来，学院一直秉承“继承与发展”的方针，注重学术积累，已逐步形成覆盖水文、水资源、水环境及3S技术应用领域的比较稳定的研究方向，有一支理论基础深厚、实践经验丰富的老、中、青相结合的学术带头人和学术骨干队伍，有全国较齐全的水文图书资料和先进的实验研究设施，并与国内外水文水资源领域著名的学术机构建立了良好的合作关系。紧密跟踪与引导学科发展趋势，积极参与解决国民经济建设中的重大水文水资源及环境问题，总体上居国际先进水平。
学院设有水文与水资源工程系、城市资源环境系、水务工程系、国际水文水资源及环境培训与研究中心、中德水资源研究所、水文水利自动化研究所、
水文水资源研究所、水生态环境研究所、水资源环境实验中心，拥有国家重点学科“
水文学及水资源”，具有“
水文水资源与水利工程科学国家重点实验室”和“水资源高效利用与工程安全国家工程中心”研究基地，一个
博士后流动站，三个博士学位授权点：水文学及水资源、生态水利、城市水务，五个硕士学位授权点：水文学及水资源、生态水利、城市水务、人文地理和自然地理。
学院现有教职工91人，双聘院士4名，教授26名，博士生导师21名，副高22名，具有博士学位者51人。设有“
水文与水资源工程”、“资源环境与城乡规划管理”、“水务工程”3个本科专业。2006年
水文与水资源工程专业被评为江苏省品牌专业，2007年被遴选为国家第一批特色专业建设点并通过教育部组织的
工程教育专业认证，2008年水文专业教学团队被评为国家级教学团队。
2000年以来主持与承担1000余项包括国家973计划、863课题、
国家自然科学基金、国家科技攻关和直接服务于国民经济建设的科研项目，经费总额2.77亿元，发表论文3000余篇，出版专著和教材30多部，获部省级以上奖51项，参与国际学术交流300多人次。