云南纳帕海省级自然保护区，位于云南省迪庆藏族自治州香格里拉市，总面积2400公顷，三面环山，山峰海拔3800—4449米，处于东经99°37′—99°40′，北纬27°49′—27°55′。

云南纳帕海省级自然保护区，位于云南省迪庆藏族自治州香格里拉市，在香格里拉县城城西北部，距县城8千米，处于东经99°37′—99°40′，北纬27°49′—27°55′。

云南纳帕海省级自然保护区属于亚热山沼泽和沼泽化草甸，三面环山，山峰海拔3800—4449米。

云南纳帕海省级自然保护区属寒温带高原季风气候区西部型季风气候。受南北向排列的山地和大气环流的影响，全年盛行南风和南偏西风。干湿季分明，11月至次年5月为明显干季，5—11月为明显湿季。纳帕海虽位于中亚热带水平气候带内，但由于地处青藏高原的东南延伸部分，而具明显的高原气候特征，太阳辐射强，年日照时数平均2180小时，气温年较差小，日较差大，长冬无夏，春秋短，年均温5.4℃，最热月7月均温13.2℃，最冷月1月均温-3.7℃，10℃活动积温1392.8℃，气温年较差平均16℃，气温日较差平均可达20℃，干季时可达30℃。纳帕海位于多雨区与少雨区的过渡地带，年平均降水量620毫米，每年有霜期约125天，9月至次年5月有雪。

纳帕海是高原季节性湖沼。夏末秋初，雨水频降，再加上青龙潭、纳曲河、旺曲河水的注入，形成大面积湖面，水面最大时可达上千公顷。

纳帕海还是季节性天然湖泊。由一系列淡水池塘、沼泽组成，由周围山里的8条小河供水。湖水从西北隅溶洞汇入地下河，再经溶洞流往尼西乡汤姆堆排出，注入金沙江。纳帕海水量补给主要依靠降雨、地表径流、冰雪融水和湖两侧沿断裂带上涌的泉水，年均产水量25700立方米。受西南季风影响，6月初形成大量降水，源自雪山森林的纳曲河、奶子河等十余条溪流汇于湖中，湖面水漫上千公顷，水深可达4—5米；但由于石灰岩漏水，8月后湖水退落，10月前后由于秋季季风退缩再次产生降雨，湖水再次上涨使湖面增至3125公顷，并于11月后退落，湖水退落后湖面大幅度缩小，湖水从西北角的9个落水洞泄入地下河，穿过北部小背斜，潜流10千米后出露形成支流汇入金沙江，汇水流量变小，湖面缩小至500公顷左右。

云南纳帕海省级自然保护区主要土壤类型为沼泽土和泥炭土，pH8.02，土壤有机质含量平均85.30克/千克，全氮含量平均2.71克/千克，水解氮含量平均324.76毫克/千克，速效磷含量3.7—5.7毫克/千克，速效钾含量平均124.81毫克/千克，属于较肥沃的土壤。

云南纳帕海省级自然保护区面积2400公顷，其西、北侧边界为坝区周边山体山脚线，东、东南侧边界为西内环公路以西。

云南纳帕海省级自然保护区由于海拔高差明显，形成了丰富多样的植被类型。虽然云南纳帕海省级自然保护区处于山地环境，海拔在3200米以上，不利于水生植被的全面发展，但水生植物群落类型及其区系组成却比长江中下游湖泊湿地丰富。纳帕海的水生植被群落也较为复杂，区系组成上以温带成分为主，包含了世界广布、旧世界热带分布、北温带分布、东亚分布、极高山地理成分和淡水湖泊特有植物群落类型等6大地理成分，而且珍稀濒危和特有物种比例高，不仅具有中国国内湿地大部分水生植物群落，还具有长江中下游平原湿地所不具有的北极—高山类型（杉叶藻群落）。世界广布的亮叶眼子菜群落、水葱群落、丝草群落、芦苇群落以本带为分布的上限，北极—高山分布的杉叶藻以本带作为分布的下限。

云南纳帕海省级自然保护区的动物以东洋界西南区的种类为主，南北动物均在此交汇，垂直分化明显，特有动物种类丰富，有许多横断山区的特有种或更狭窄范围的特有种类，脊椎动物种群小，数量少，濒危种类和重点保护种类多。在纳帕海重要动物区系中，鸟类占有重要位置，而鸟类区系组成中尤为突出的是丰富的横断山区特有成分和本地特有成分，许多都是珍稀濒危物种，如国家一级重点保护的有黑颈鹤、黑鹳、胡兀鹫、白尾海雕；国家二级重点保护的有白琵鹭、大天鹅、白马鸡；中日候鸟及栖息地保护协定中的鸟类有赤麻鸭等重要水禽。

云南纳帕海省级自然保护区具有不能脱离湿地水域生活的水鸟31种，且种群数量大，如广布种中的绿头鸭、斑头雁、绿头鸭，古北种中的赤麻鸭等雁鸭类就有近万只，表明纳帕海湿地是高原重要的水禽越冬地和候鸟迁徙途中的补给站。

黑颈鹤每年9月至次年3月在此停留半年。1984—1985年冬天，出现63只，1985—1986年冬天，曾有过130只的记录。灰鹤少量出现，丹顶鹤曾记录为迷鸟，也曾记录到黑鹳。

云南纳帕海省级自然保护区扬名于黑颈鹤，可除了黑颈鹤之外，这里还有省级保护动物灰雁、斑头雁和灰鹤及大量水禽。

其他来云南纳帕海省级自然保护区越冬鸟类有：赤麻鸭、斑头雁、绿头鸭、黑鹳、灰头鹤、大白鹭、中白鹭、金雕、秃鹫等。

云南纳帕海省级自然保护区度夏留鸟的种群及数量也在逐年递增，凤头䴙䴘、骨顶鸡等候鸟在纳帕海繁殖成为留鸟。

2019年，云南纳帕海省级自然保护区首次出现数量众多的度夏鸟类，其中小白鹭及牛背鹭600余只。

2021年7月，云南纳帕海省级自然保护区共监测到鸟类55种4770只，其中包括骨顶鸡、牛背鹭、白鹭、凤头䴙䴘等种类。

云南纳帕海省级自然保护区属湿地生态类型保护区，主要保护对象为黑颈鹤、黑鹳、灰鹤等国家Ⅰ、Ⅱ级重点保护鸟类、越冬水鸟及亚高山湿地生态系统。

2012年，云南纳帕海省级自然保护区开始执行“禁渔令”，以保障候鸟的食物供给。

2016年，云南纳帕海省级自然保护区实施湿地生态效益补偿项目，同时开展了废旧围栏拆除、哈木谷保护区核心区内牵马设施搬迁等湿地保护恢复项目。

2020年，香格里拉市开展云南纳帕海省级自然保护区周边马场运营专项整治，对10个马场进行规划改造和规范管理，将牵马线路远离湿地及保护区。

1984年，云南纳帕海省级自然保护区经云南省人民政府批准成立省级自然保护区。

2004年，云南纳帕海省级自然保护区被列入国际重要湿地名录。

2023年11月30日，国家林业和草原局公布《陆生野生动物重要栖息地名录（第一批）》，云南香格里拉纳帕海黑颈鹤重要栖息地入选。

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