胞囊也称
包囊，是指
低等植物（如分裂菌、
硅藻、
绿藻等）和
原生动物（如
痢疾内变形虫等）在休止状态或外界环境条件改变时，身体外围分泌一种
蛋白质的膜，以度过恶劣环境。
后生动物如某些原环虫，也能形成胞囊，度过干、寒等逆境。
在正常的环境条件下，所有的原生动物都各自保持自己的形态特征。若环境条件变坏，如水干涸、水温和pH过高或过低，
溶解氧不足，缺乏食物或
排泄物积累过多，污水中的有机物浓度超过原生动物的适应能力等情况，都可使原生动物不能正常生活而形成胞囊。所以，胞囊是抵抗不良环境的一种休眠体。
胞囊形成过程如下：先是虫体变圆，
鞭毛、
纤毛或
伪足等
细胞器缩入体内或消失，细胞水分陆续由伸缩泡排出，虫体缩小，最后
伸缩泡消失，分泌一种胶状物质于体表，过一段时间后凝固形成胞壳。胞壳有两层，外层较厚，表面凸起，内层薄而透明。胞囊很轻易随灰尘飘浮或被其他动物带至他处，胞囊遇到适宜环境其胞壳破裂恢复虫体原形。
所有原生动物在污水生物处理过程中都起
指示生物的作用。一旦形成胞囊，就可判断
污水处理不正常，至于是什么原因引起的，要进一步查找。在
光学显微镜下看到的胞囊是何种原生动物的胞囊，要根据经验判断，以其个体大小和出现胞囊之前的原生动物的种类等方面综合分析和判断。
有些细菌，如
固氮菌和
黏细菌能形成胞囊，它的形成不同于内生
芽孢，形成胞囊时在细胞外面淀积数层保护膜。胞囊具有抗干燥的作用，但不耐热。
有些
金藻常在夏季干旱或冬季寒冷时由
营养细胞形成特殊的内生不动孢子，即胞囊，以渡过不良环境。形成胞囊时。细胞停止运动并变圆，在
原生质里面先分泌出一层纤维素膜，并逐渐变厚，有
二氧化硅堆积而变硬，顶端有一开孔，膜外
原生质经孔口移入膜内，孔口由一胶质塞或硅化塞封闭起来，
原生质内积累大量的
金藻昆布糖和油。不能运动的种类，以
游动孢子进行生殖，
游动孢子有1或2条
鞭毛。
①通过盆栽与田间试验，对大豆
根瘤菌与
光合细菌混合接种进行了研究。结果表明，混合接种提高了大豆根瘤的
固氮酶活性和土壤固氮强度；增加了土壤好气性细菌、
真菌、
放线菌、
固氮菌的数量；减轻了
大豆胞囊线虫危害。
②应用组织染色及石蜡切片技术、同工酶电泳技术、聚酰胺薄膜层析技术、RAPD技术及生物间遗传学原理，从大豆胞囊线虫的宏观群体动态、抗性品种基因归类和推导到微观的组织病理学、线虫发育及雌雄分化、根分泌物中低分子肽/
氨基酸及
功能蛋白以及抗性基因的分子标记等不同方面系统地研究了大豆与大豆胞囊线虫的相互关系，取得了以下研究进展：不同抗性品种与大豆胞囊线虫群体互作的研究中，首次揭示了不同抗性大豆品种对大豆胞囊线虫3号生理小种群体动态的变化，明确了不同抗性品种对其根内线虫的发育和雌雄分化的影响，并对大豆胞囊线虫3号生理小种休眠进行初步研究。首次提出
大豆胞囊线虫二龄幼虫高峰的出现与大豆根系新老更替密切相关的观点，并研究了
线虫的侵入和分布与根系发育的时空动态。