蜥蜴亚目指的是脊索动物门，脊椎动物亚门，爬行纲的一个亚目，现分类已将其提升为蜥蜴目。体表被以角质鳞片；绝大多数蜥蜴类有四肢，少数种类四肢退化，但肢带残存；左右下颌骨在前端紧密结合，上下颌骨表面着生有齿；尾长一般超过体长；具有成对的交接器；多数种类有活动眼睑和鼓膜。栖息方式多样，有陆栖、穴居、水栖、树栖等。

爬行纲具有明显的头、颈、躯、四肢和尾部。少数种类四肢退化(如蛇蜥)，但尚存肩带。胸骨存在，肋骨与胸骨相连接。下颌左右两侧以骨缝相连。鼓膜明显，有外耳道。体表复盖许多角质，有的鳞下有小骨板。鳞的形态和排列是分类的依据之一。蜥蜴类生活范围广泛，树间滑期的具有翼状皮膜，适应爬行的体多扁平，普于疾走和树栖的体多侧扁，四肢及尾细长，穴居的体圆柱状，四肢退化。一般以昆虫蜘蛛、虫及软体动物为主要食料。大多分布于南半球热带和亚热带地区，少数种类分布在北极圈内。中国的蜥蝎大多产于华南地区。世界约有3000余种，分属20科，中国产110余种，分属8科。

蜥蜴亚目动物在外形上可区分为头、颈、躯干和尾四部分，绝大多数具有五趾型附肢，少数种类附肢退化或消失，但仍有带骨或其残迹。

这类动物的椎体关节，除壁虎科为双凹型外，其余均是前凹型。椎体分化为颈椎、躯干椎、荐椎和尾椎四部分。颈椎又分化为环椎、枢椎和数枚普通颈椎。肋骨与躯干骨相连，但仅前面几对与胸骨连接而构成胸廓。骶椎不超过两枚。尾椎多枚，常因自截而断落，截断的位置可在两椎骨之间，也可在椎体中部。头骨属双颞窝型，但已失去下颞下颞弓，仅保留了颞上窝。方骨与颅骨形成可动关节，左右下颌骨呈缝接状，连接牢固。前颌骨、上颌骨及齿骨上常具齿。在鬣蜥科、石龙子科及蜥蜴科的许多种类中，腭骨上亦具牙齿。依齿着生的方式，蜥蜴亚目动物的齿分为两种类型，鬣蜥科和壁虎科为端生齿，其余的科为侧生齿。犁鼻器发达。大多数种类的舌呈扁平型，无舌鞘。

本亚目动物多有一发达的囊状肺，具有羊膜动物特有的呼吸方式，但先靠一组肋间肌收缩，使胸廓缩小进行主动呼气，当这组肋间肌舒张时，由于气压差则产生被动吸气，到肺内压与空气压相等时另一组肋间肌开始收缩，使胸廓扩大而行主动吸气。因此，每个呼吸周期经过了主动呼气一被动吸气主动吸气三个阶段。

蜥蜴类的泄殖腔被皱褶隔为粪道和泄殖道，两者以横裂的泄殖孔开口于体外。雄体具有一对管状的交接器，其内壁常具刺状或乳头突起，或具环状皱褶。交接器位于泄殖孔外角后方的尾基两侧。交配时仅使用一侧的交接器，以其内壁翻出体外，插入雌体的泄殖腔，进行体内受精。

多数为卵生，卵壳除壁虎科和双足蜥科为钙质外，其余均为革质。胚胎吻端均具钙质卵齿。大多数种类具发达的膀胱。

体表被角质鳞，石龙子科和蛇蜥科的种类在鳞片下还有真皮骨化形成的小骨片。角质表皮除蛇形种类以整张皮蜕下外，其余种类以小片状脱落。

鼻孔一对，多为椭圆形，位于吻端两侧。眼较发达，除壁虎科大多数种类外，下眼睑可向上运动使眼闭合。有些种类具发达的顶眼。鼓膜外露或下陷于外耳道内方，外耳孔多为椭圆形。少数种类中耳退化，鼓膜消失，耳柱骨和方骨合二为一。鬣蜥科、壁虎科、蜥蜴科、巨蜥科和双足蜥科的大多数种类具股窝或鼠蹊窝或肛前窝。

蜥蜴亚目动物分布广泛，除南极外遍布世界各地，多数种类分布于热带、亚热带地区。以陆栖为主，也有树栖、穴居、半水栖的种类。全世界共有3000余种，隶属于约20科300余属。我国已知9科39属156种。河北分布有4科5属8种。

蜥蜴类广布于除南极洲外的全球陆地，中国有蜥蜴类150余种，分布遍及全国。云南省有蜥蜴种类43种。

蜥蜴是爬虫类中种类最多的族群，全世界已知超过3,000种，主要分布于热带。体型差异很大，从数厘米大的加勒比壁虎，到近3米长的科莫多龙都有。

有些被称为蛇蜥的种类脚已经退化，只留下一些脚的痕迹构造。它们因为有眼睑和耳朵，所以能与蛇区分。

许多蜥蜴能变换它们的颜色以因应环境的变化或压力，例如变色龙。

大部份的种类为肉食性，以昆虫、蚯蚓、蜗牛，甚至老鼠等为食。但也有以仙人掌或海藻为主食，或是杂食性的。

与其近缘的蛇亚目（Serpentes）合计占整个现存爬虫类的95%。共分18科，3,000多个种。热带地区种类和数量最多。从北极到非洲南部、南美洲和澳大利亚皆有分布。

多数蜥蜴昼间活动，壁虎多在薄暮至破晓之间活动，并能发出大声（而大部分蜥蜴不能发声）。蜥蜴的捕食方式为静候或搜寻。许多蜥蜴能将尾部自割，断下的尾能迅速扭动以分散捕食者的注意，蜥蜴得以逃脱。许多蜥蜴有领域行为（包括领域表演）或求偶表演。许多种有股孔，可能用来分泌化学物质以吸引异性。蜥蜴对于人的经济意义不大。某些鬣蜥可食，有些可制革。壁虎栖于居室，可捕害虫，但可能传播沙门氏菌。蜥蜴是生物学的重要研究材料，又常饲为玩赏动物。

蜥蜴类具交接器，行体内受精。一般在春末夏初进行交配繁殖。有的种类的精子可在雌体内保持活力数年，交配一次后可连续数年产出受精卵。在一部分蜥蜴中只发现雌性个体，据研究，它们是行孤雌繁殖的种类。这类蜥蜴的染色体往往是异倍体。有的正常行两性繁殖的种类，在一定环境条件下会改行孤雌繁殖，据认为，孤雌繁殖有利于全体成员都参与产生后代，有利于迅速扩大种群，占据生存领域。

多数种类蜥蜴系卵生（Oviparous）、一般于夏季产卵于温暖潮湿而隐蔽的地方。卵数由一二杖到十几枚不等。卵的大小与该种个体的大小有一定的关系。壁虎科的卵略近圆形，卵壳钙质较多，壳硬而脆。其他各种蜥蜴的卵多为长椭圆形，壳革质而柔韧。

有的蜥蜴卵在母体输卵管后段（“子宫”）就开始发育，直到产出仔蜥，叫做卵胎生（Ovoviviparous）。石龙子科中不少种类为卵胎生，其余各科蜥蜴多为卵生。同一属中有的种类为卵生，另一些种类则为卵胎生。譬如南蜥属中多线南蜥（Mabuya multifasciata）为卵胎生，多凌南蜥（M．multicarinata）为卵生。又如滑蜥属中两个相近种秦岭滑蜥（Scincella. tsinlingensis）为卵胎生，而康定滑蜥（S．Potanini）却为卵生。中国特产动物鳄蜥（shinisaurus crocosilurus）在当年年底仔蜥就在母体输卵管内发育成熟，但延滞到第二年5月才产生母体外。解剖怀孕后期的鳄蜥，成熟仔蜥已无卵黄，而母体输卵管壁布满微血管网。可能发育后期的仔蜥依靠母体提供营养，应属于少数胎生（Viviparous）蜥蜴之一。

蜥蜴一般每年繁殖一次。但在热带温暖潮湿环境的一些种类，如岛蜥（Emoiatrocostata）、多线南蜥、蝎虎（Platyurus plaryurus）、疣尾蜥虎（Hemidactylus frenatus）与截趾虎（Gehyra mutilata）等则终年都可繁殖。

蜥蜴的寿命主要根据动物园饲养的资料，飞蜥2~3年，岛蜥4年，多线南蜥5年，巨蜥（Varanus salvator）12年，毒蜥（Helodermasuspentum）25年，最长的纪录大概是一种蛇蜥（Anguis fragilis）54年。这些数字并不完全反映自然界的实际情况，只可能作一参考。

蜥蜴是变温动物，在温带及寒带生活的蜥蜴于冬季进入休眠状态，表现出季节活动的变化。在热带生活的蜥蜴，由于气候温暖，可终年进行活动。但在特别炎热和干燥的地方，也有夏眠的现象，以度过高温干燥和食物缺乏的恶劣环境。可分为白昼活动、夜晚活动与晨昏活动三种类型。不同活动类型的形成，主要取决于食物对象的活动习性及其他一些因素。

个体蜥蜴的活动范围很局限。树栖蜥蜴往往只在几株树之间活动。据研究过的几种地面活动的蜥蜴，如多线南蜥等，活动范围平均在1，000平方米左右。有的种类还表现出年龄的差异。刚孵出的蝘蜓（Sphenomorplus）多在孵化地水域附近活动，成年后才转移到较远的林中活动。

大多数蜥蜴吃动物性食物，主要是各种昆虫。壁虎类（Gekkonids）夜晚活动，以鳞翅目等昆虫为食物。体型较大的蜥蜴如大壁虎（蛤蚧，Gekkogecko）也可以小鸟，其他蜥蜴为食物。巨蜥（Varanus）则可吃鱼、蛙甚至捕食小型哺乳动物。也有一部分蜥蜴如鬣蜥（Agama）以植物性食物为主。由于大多数种类捕吃大量昆虫，蜥蜴在控制害虫方面所起的作用是不可低估的。很多人以为蜥蜴是有毒动物，这是不对的。全世界6000种蜥蜴中，已知只有两种有毒毒蜥，隶属于毒蜥科（Helodermatidae），且都分布在北美及中美洲。

许多蜥蜴在遭遇敌害或受到严重干扰时，常常把尾巴断掉，断尾不停跳动吸引敌害的注意，它自己却逃之夭夭。这种现象叫做自截，可认为是一种逃避敌害的保护性适应。自截可在尾巴的任何部位发生。但断尾的地方并不是在两个尾椎骨之间的关节处，而发生于同一椎体中部的特殊软骨横隔处。这种特殊横隔构造在尾椎骨骨化过程中形成，因尾部肌肉强烈收缩而断开。软骨横隔的细胞终生保持胚胎组织的特性，可以不断分化。所以尾断开后又可自该处再生出一新的尾巴。再生尾中没有分节的尾椎骨，而只是一根连续的骨棱，鳞片的排列及构造也与原尾巴不同。有时候，尾巴并未完全断掉，于是，软骨横隔自伤处不断分化再生，产生另一只甚至两只尾巴，形成分叉尾的现象。中国壁虎科、蛇蜥科、蜥蜴科及石龙子科的蜥蜴，都有自截与再生能力。

蜥蜴的变色能力很强，特别是避役类（Chamaeleons）以其善于变色获得“变色龙”的美名。中国的树蜥与龙蜥多数也有变色能力，其中变色树蜥（Calots versicolor）在阳光照射的干燥地方通身颜色变浅而头颈部发红，当转入阴湿地方后，红色逐渐消失，通身颜色逐渐变暗。蜥蜴的变色是一种非随意的生理行为变化。它与光照的强弱、温度的改变、动物本身的兴奋程度以及个体的健康状况等有关。

大多数蜥蜴是不会发声的。壁虎类是一个例外，不少种类都可以发出宏亮的声音。蛤蚧鸣声数米之外可闻。壁虎的叫声并不是寻偶的表示，可能是一种警戒或占有领域的信号。

鬣蜥下目Iguania

共分为14个科

1.Agamidae 鬣蜥科：分为6个亚科，共计56属445种

—Agaminae 鬣蜥亚科 11属124种

—Amphibolurinae 髭蜥亚科 14属100种

—Draconinae 飞蜥亚科 27属191种

—Hydrosaurinae 海蜥亚科 1属3种

—Leiolepidinae 蜡皮蜥亚科 1属9种

—Uromastycinae 刺尾蜥亚科 2属18种

2.Chamaeleonidae 避役科：共计12属200种

曾经的美洲鬣蜥科拆分成以下12个科：

3.Corytophanidae 海帆蜥科：3属9种

4.Crotaphytidae 项圈蜥科：共计2属12种

5.Dactyloidae 安乐蜥科：共计1属391种

6.Hoplocercidae 荆尾蜥科：共计3属16种

7.Iguanidae 美洲鬣蜥科：共计8属39种

8.Leiocephalidae 卷尾鬣蜥科：共计1属29种

9.Leiosauridae 平鳞蜥科：共计6属32种

10.Liolaemidae 平咽蜥科：共计3属286种

11.Opluridae 盾尾蜥科：共计2属7种

12.Phrynosomatidae 角蜥科：分为2个亚科，共计9属148种

—Phrynosomatinae 角蜥亚科 5属31种

—Sceloporinae 强棱蜥亚科 4属117种

13.Polychrotidae 四鳞爪蜥科：共计1属7种

14.Tropiduridae 嵴尾蜥科：共计8属125种

壁虎下目 Gekkota

共分为7个科

15.Gekkonidae 壁虎科：共计56属996种

16.Carphodactylidae 藁趾虎科：共计7属30种

17.Diplodactylidae 澳虎科：共计25属128种

18.Eublepharidae 睑虎科：共计6属32种

19.Phyllodactylidae 叶趾虎科：共计10属134种

20.Sphaerodactylidae 球趾虎科：共计13属209种

原本的壁虎科拆分成以上6科

21.Pygopodidae 鳞脚蜥科：共计7属44种

石龙子下目Scincomorpha

共分为7个科

曾经的非洲蜥蜴科拆分成以下2个科

22.Cordylidae 环尾蜥科：共计10属64种

23.Gerrhosauridae 板蜥科：共计7属37种

曾经的美洲蜥蜴科拆分成以下2个科

24.Gymnophthalmidae 裸眼蜥科：分为5个亚科，共计45属244种（Pantepuisaurus、Kaieteurosaurus、Adercosaurus这3个单型属未分入亚科）

—Alopoglossinae 狐舌蜥亚科 2属22种

—Cercosaurinae 梭蜥亚科 15属148种

—Ecpleopinae 全肢蜥亚科 7属34种

—Gymnophthalminae 裸眼蜥亚科 17属36种

—Rhachisaurinae 刺蜥亚科 1属1种

25.Teiidae 美洲蜥蜴科：共计16属146种

26.Lacertidae 蜥蜴科：共计44属321种

27.Scincidae 石龙子科：分为7个亚科，共计149属1582种

—Acontinae 箭蜥亚科 2属26种

—Egerniinae 胎生蜥亚科 9属58种

—Eugongylinae 圆蜥亚科 41属419种

—Lygosominae蝘蜓亚科 5属52种

—Mabuyinae 南蜥亚科 22属191种

—Sphenomorphinae 蜓蜥亚科 35属559种

—Scincinae石龙子亚科 35属277种

28.Xantusiidae 黄蜥科：共计3属34种

蛇蜥下目Diploglossa

共分为5个科

曾经的蛇蜥科拆成以下2个科

29.Anguidae 蛇蜥科：分为2个亚科，共计10属73种

—Anguinae 蛇蜥亚科 4属20种

—Gerrhonotinae 侧褶蜥亚科 6属53种

30.Diploglossidae 肢蛇蜥科：共计3属51种

31.Anniellidae 蠕蜥科：共计1属6种

32.Xenosauridae 异蜥科：共计1属10种

33.Shinisauridae 鳄蜥科：共计1属1种

双足蜥下目Dibamia

34.Dibamidae 双足蜥科：共计2属23种

巨蜥下目Platynota

共分为3个科

35.Helodermatida 毒蜥科：共计1属2种

36.Lanthanotidae 拟毒蜥科：共计1属1种

37.Varanidae 巨蜥科：共计1属74种

蚓蜥亚目（Amphisbaenia）与蜥蜴亚目近缘。体长圆柱形，具浅沟。无外耳，眼退化。穴居。均无后肢，除3属外亦缺前肢。主要分布热带。15属，约100种。