财政专户（或称财政资金专户）是各级财政部门为核算具有专门用途的资金，在商业银行及其他金融机构开设的资金账户。

按核算管理的资金类型分，我国设立的财政专户主要包括四类：即专项支出财政专户、社会保险基金财政专户、非税收入收缴财政专户、外国政府和国际金融组织贷款赠款财政专户。按照规定，设立财政专户需有国务院及其财政部门、省级人民政府及其财政部门正式文件作为依据。社会保险基金财政专户则是依据《社会保险法》设立的。

专项支出财政专户主要是为满足从公共预算等预算安排并按规定实行专户管理的专项资金核算管理需要，以及满足代管资金需要等设立的。专项支出专户资金来源主要包括：一是从国库单一账户拨入。例如，《国务院关于印发<粮食风险基金实施意见>的通知》（国发[1994]31号）规定的粮食风险基金、《退耕还林条例》（国务院令第367号）规定的退耕还林资金等，均从国库单一账户拨入粮食风险基金专户、退耕还林资金专户等管理，专门用于支付国家储备粮油的利息费用、退耕还林粮食补助等；又如，用于开展国库现金管理的资金，从国库单一账户拨入国库现金管理专户，采用定期存款方式存储，在存款到期后，将本息全部转回国库单一账户；二是从预算单位转入。一些地方为加强预算单位资金管理，取消了预算单位实有资金账户，把预算单位资金转入相应财政专户管理，支出时根据预算单位申请支付到最终收款人；三是缴款人上缴。例如，《国务院办公厅关于加强汶川地震抗震救灾捐赠款物管理使用的通知》（国办发[2008]39号）规定，缴款人向民政部门捐赠的汶川地震抗震救灾资金，纳入救灾捐赠资金专户管理，支出时根据资金指定用途和相关部门申请支付到最终收款人。

社会保险基金财政专户主要是为满足基本养老保险基金、基本医疗保险基金等各类社会保险基金核算管理需要设立的。社保专户资金来源主要包括：一是从国库单一账户拨入。例如，预算安排的社会保险基金财政补助资金，从国库单一账户拨入社保专户。二是社会保险费征收机构转入。例如，税务机关或社会保险经办机构征收的社会保险缴费收入，要及时转入社保专户。三是社会保险基金保值增值收入。例如，利用社会保险基金财政专户结余资金定期存款获得的本息收入或购买国债兑付的本息收入，要全部转入社保专户。社保专户资金支出根据社保等相关部门的申请，通过社保经办机构支付给个人或医疗机构等相关单位。

非税收入收缴财政专户主要是为满足广大缴款人缴纳款项和执收单位核对账务需要设立的。由于传统的向国库经收处缴纳非税收入的做法不能提供缴款明细信息，无法满足执收单位管理需要，也不方便缴款人缴款，为此，根据收入收缴改革方案，财政部门在非税收入收缴代理银行设立专户，用于归集各项非税收入资金和匹配收缴信息（包括缴款人、执收单位、非税收入项目、金额等）。非税收入专户资金主要来自缴款人缴款，在完成信息匹配并确认收入后，纳入预算管理的资金要及时足额缴入国库，实行“收支两条线”；对教育收费、彩票发行费等按规定纳入财政专户管理的资金，则保留在财政专户，支出时，从财政专户拨付给预算单位。

外国政府和国际金融组织贷款赠款财政专户主要是满足国际贷赠款资金核算管理需要，根据贷赠款方要求开设，原则上一个项目开设一个账户。由于在人民银行开设的国库单一账户只能核算人民币资金，财政部门接受的外币贷赠款资金，以及用于偿还贷款的外币资金，按照现行外汇资金管理规定，只能在商业银行开设账户进行管理。国际贷赠款专户资金来源主要包括外国政府和国际金融组织提供的贷款和赠款，如世界银行提供的卫生项目贷款、英国政府提供的中国结核病控制项目赠款等，资金支出时按照外国政府和国际金融组织贷款赠款管理办法等有关规定，根据用款单位申请支付给最终收款人。

此外，过去为了对预算外资金收支统一核算和集中管理，《预算外资金管理实施办法》规定预算外资金由财政部门建立统一财政专户，实行收支两条线管理。但在2010年预算外资金纳入预算管理以后，预算外资金财政专户也已经取消，随着预算外资金一同成为了历史。