转运RNA(Transfer RNA),又称传送核糖核酸、
转移核糖核酸,通常简称为tRNA,是一种由76-90个核苷酸所组成的RNA,其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下,接附特定种类的氨基酸。转译的过程中,tRNA可借由自身的反密码子识别mRNA上的密码子,将该密码子对应的氨基酸转运至核糖体合成中的多肽链上。每个tRNA分子理论上只能与一种氨基酸接附,但是遗传密码有简并性(degeneracy),使得有多于一个以上的tRNA可以跟一种氨基酸接附。
研究历史
在tRNA被发现以前,佛朗西斯·克里克就假设有种可以将
RNA讯息转换成
蛋白质讯息的适配分子存在。1960年代早期,亚历山大·里奇、唐纳德·卡斯帕尔等生物学家开始研究tRNA的结构,1965年,罗伯特·W·霍利首次分离了tRNA,并阐明了其序列与大致的结构,他因此贡献而获得1968年的
诺贝尔生理学或医学奖。tRNA最早由罗伯特·M·博克(Robert M. Bock)成功结晶,之后陆续有人提出tRNA苜蓿叶状的二级结构,此结构于1973年由金成镐与亚历山大·里奇的
X射线衍射分析证实。另一个由阿龙·克卢格领导英国团队,在同一年发布同样的射线晶体学的发现。
定义
大多数tRNA由七十几至九十几个核苷酸折叠形成的三叶草形短链组成,
相对分子质量为25000〜30000,沉降常数约为4S。旧称联接RNA、可溶性RNA等。主要作用是携带氨基酸进入核糖体,在mRNA指导下合成蛋白质,即以mRNA为模板,将其中具有密码意义的核苷酸顺序翻译成蛋白质中的氨基酸顺序。tRNA与mRNA是通过反密码子与密码子相互作用而发生关系的。在肽链生成过程中,第一个进入核糖体与mRNA起始密码子结合的tRNA称为
起始tRNA,其余tRNA参与肽链延伸,称为延伸tRNA,按照mRNA上密码的排列,携带特定氨基酸的tRNA依次进入核糖体。形成肽链后,tRNA即从核糖体释放出来。整个过程称为tRNA循环。一种tRNA只能携带一种氨基酸,如
丙氨酸tRNA只携带丙氨酸,但一种氨基酸可被不止一种tRNA携带。同一生物中,携带同一种氨基酸的不同tRNA称作“同功受体tRNA”。组成蛋白质的氨基酸有20种,根据密码子摆动学说至少需要31种tRNA,但在脊椎动物中只存在22种tRNA。这主要是通过
密码子-
反密码子配对的简化实现的,使得一种tRNA可以识别一个密码子家族的全部4个密码子。携带同一种氨基酸的细胞器tRNA与细胞质tRNA也不一样。生物体发生突变后,校正机制之一是通过校正
基因合成一类校正tRNA,以维持翻译作用译码的相对正确性。可以有多种校正tRNA携带同一种氨基酸。
结构
转运RNA分子由一条长70~90个
核苷酸并折叠成三叶草形的短链组成的。上图中有两种不同的分子,
苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA链的两个末端在图上方指出的L形结构的末端互相接近。氨基酸在箭头示意的位置被连接。在这条链的中央形成了L形臂,如图《tRNA的三叶草结构》下方所示,露出了形成
反密码子的三个核苷酸。
三叶草结构的其余两环被包裹成肘状,在那里它们提供整个分子的结构。四个常见RNA碱基---
腺嘌呤,
尿嘧啶,
鸟嘌呤和
胞嘧啶显然不能提供足够的空间以形成一个坚固的结构,因为这些
碱基大部分被修饰过以延长它们的结构。有两个奇特的例子,看37号
反密码子相邻的
碱基,位于
甲硫氨酸tRNA(1yfg)或
苯丙氨酸tRNA(4tna和6tna)的起始部位。
一级结构
自1965年R.W.霍利等首次测出酵母
丙氨酸tRNA的一级结构即核苷酸排列顺序到1983年已有200多个tRNA(包括不同生物来源、不同器官、细胞器的同功受体tRNA以及校正tRNA)的
一级结构被阐明。按照A-U、G-C以及G-U
碱基配对原则,除个别例外,
二级结构
tRNA分子均可排布成三叶草模型的
二级结构。它由3个环,即D环〔因该处
二氢尿苷酸(D)含量高〕、反密码环(该环中部为
反密码子)和TΨC环〔因绝大多数tRNA在该处含
胸苷酸(T)、
假尿苷酸(Ψ)、
胞苷酸(C)顺序〕,四个茎,即D茎(与D环联接的茎)、反密码茎(与反密码环联接)、TΨC茎(与 TΨC环联接)和氨基酸接受茎〔也叫CCA茎,因所有tRNA的分子末端均含胞苷酸(C)、胞苷酸(C)、
腺苷酸(A)顺序, CCA是连接氨基酸所不可缺少的〕,以及位于反密码茎与TΨC茎之间的
可变臂构成。不同tRNA的可变臂长短不一,核苷酸数从二至十几不等。除可变臂和D环外,其他各个部位的
核苷酸数目和
碱基对基本上是恒定的。图《tRNA晶体的三维结构》也示出tRNA分子中出现的保守或半保守成分。这些成分对维系tRNA的
三级结构是很重要的。
tRNA的结构特征
tRNA的结构特征之一是含有较多的修饰成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。
1974年用X射线
晶体衍射法测出第一个tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶体的三维结构,分子全貌象倒写的英文字母L,呈扁平状,长60埃,厚20埃,如《tRNA晶体的三维结构》所示,它是在tRNA
二级结构基础上,通过氨基酸接受茎与TΨC茎以及D茎与反密码茎间折叠成右手反平行双螺旋。tRNA
三级结构由保守或半保守成分与构成二级结构的核苷酸之间形成
氢键(称三级结构氢键)维系。其他tRNA晶体的三维结构类似酵母苯丙氨酸tRNA,只是某些参数有所不同。tRNA在溶液中的构型与其晶体结构一致。
功能
主要是携带氨基酸进入
核糖体,在mRNA指导下合成蛋白质。即以mRNA为模板,将其中具有密码意义的核苷酸顺序翻译成蛋白质中的氨基酸顺序(见蛋白质的
生物合成、核糖体)。tRNA与mRNA是通过
反密码子与密码子相互作用而发生关系的。在
肽链生成过程中,第一个进入核糖体与mRNA
起始密码子结合的tRNA叫起始tRNA,其余tRNA参与肽链延伸,称为延伸tRNA,按照mRNA上密码的排列,携带特定氨基酸的tRNA依次进入
核糖体。形成肽链后,tRNA即从核糖体释放出来。整个过程叫做tRNA循环,如《tRNA循环》所示。tRNA靠反密码子与mRNA识别,但并非一种反密码子只能识别一种
密码子。例如反密码子CIG(I是
次黄嘌呤核苷酸)能识别三种密码子。一般
反密码子中的稀有核苷酸因配对不严格而能识别多种密码子,这种现象在生物学中称为“摆动性”。
tRNA是通过分子中3′端的CCA携带氨基酸的。氨基酸连接在
腺苷酸的2′或3′OH基上,携带了氨基酸的tRNA叫氨酰tRNA,例如,携带甘氨酸的tRNA叫甘氨酰tRNA。氨基酸与tRNA的结合由
氨酰tRNA合成酶催化,分二步进行:①氨基酸+ATP→氨酰-AMP+
焦磷酸;②氨酰-AMP+tRNA→氨酰-tRNA+AMP。与一种氨基酸对应的至少有一种tRNA和一种氨酰-tRNA合成酶(见
蛋白质生物合成)。
tRNA还具有其他一些特异功能,例如,在没有核糖体或其他核酸分子参与下,携带氨基酸转移至专一的
受体分子,以合成细胞膜或细胞壁组分;作为
反转录酶引物参与DNA合成;作为某些酶的抑制剂等。有的氨酰-tRNA还能调节氨基酸的
生物合成。在许多植物病毒RNA分子中发现有类似于tRNA的
三叶草结构,有的也能接受氨基酸,其功能不详。
合成方法
生物合成:在生物体内,
DNA分子上的tRNA基因经过转录生成
tRNA前体,然后被加工成成熟的tRNA:
tRNA前体的加工包括:切除前体分子中两端或内部的多余核苷酸;形成tRNA成熟分子所具有的修饰核苷酸;如果前体分子3′端缺乏CCA顺序,则需补加上CCA末端。加工过程都是在
酶催化下进行的。
人工合成:1981年,中国科学家
王德宝等用化学和酶促合成相结合的方法首次
全合成了酵母
丙氨酸tRNA。它由76个
核苷酸组成,其中包括天然分子中的全部修饰成分,产物具与天然分子相似的
生物活性(见核糖核酸和核酸人工合成)。