重庆交通科研设计院成立於1965年5月，系直属交通部管理的正厅级科研事业单位。2000年根据国务院的决定，转制为科技企业，整建制进入招商局集团。是中央在渝科研单位和甲级勘察设计院，是国家山区公路工程技术研究中心和桥梁工程结构动力学国家重点实验室的依托单位。

我院主要从事公路行业与市政行业的道路工程、桥梁工程、隧道工程、交通工程、轨道交通、环境保护与节能工程、公路机动车工程等领域的科研开发、勘察设计、试验检测、产品制造、工程施工、技术转让、技术咨询、工程总承包等生产与服务，不断应用科技创新成果，为全国公路交通建设提供技术服务。我院已经发展成为全国交通系统重要的科技开发、成果转化和产业化基地之一。

由国家有关部门审查批准，依托我院设立有1个部省级工程检测中心、1个部省级工程技术研究中心，2个部省级重点实验室、2个国家级质监中心、1个国家重点实验室和1个国家工程技术研究中心，全院具有一系列重要的科技创新平台。（重庆公路工程检测中心、重庆市电磁兼容工程技术研究中心、隧道建设与养护技术交通行业重点实验室、桥梁结构抗震技术交通行业重点实验室、国家客车质量监督检验中心、国家摩托车质量监督检验中心、桥梁工程结构动力学国家重点实验室、国家山区公路工程技术研究中心）。

2006年我院被国家科技部、国务院国资委和中华全国总工会国家三部委确定为全国首批103家创新型企业试点单位之一。并于2008年7月被正式认定为首批国家“创新型企业”。

转制以来，承担了国家自然基金项目、国家973计划项目、国家863计划项目、国家支撑计划项目、科技部技术开发研究资金项目、交通部西部交通建设科技项目、世界自然基金会资助项目和企业委托的科研项目等各类项目。每年承担的科研项目都保持在80多项。

我院拥有中国有效发明专利6项，实用新型专利14项，计算机软件著作权1项，已编制完成国家标准规范15项、行业标准规范31项，正在编制的国家和行业标准规范共13项。

我院拥有工程勘察设计等八项甲级资质证书并于1999年通过ISO9001国际标准质量体系认证。自2000年来，我院已经连续八年进入建设部排名的全国勘察设计单位100强。承担了大量的重大工程项目，并荣获了多项詹天佑大奖、鲁班奖、国家设计特奖和国家、省部级优秀设计奖。

我院拥有一支技术优势突出、工作勤勉敬业的优秀科技人才队伍。全院共有职工1700多人，正高级职称47人，副高级职称233人， 博士和硕士共182人，其中包括国家级突出贡献专家和享受政府特殊津贴专家23人，交通部专家委员会委员和全国交通青年科技英才4人，交通部“十百千人才工程”第一层次人选5人，重庆市学术带头人和“322重点人才工程”人选17人，硕士生导师和博士生导师35人。经国家人事部批准正式设立博士后科研工作站。

全院已完成科研项目435项，获得各级奖励216项，其中国家级奖22项，省部级奖177项。

我院获得了全国“交通系统先进集体”、“守合同重信用企业”、 “全国职业道德建设十佳单位”、“五一劳动奖状” 和中央组织部与国务院国资委授予的全国国有企业“四好领导班子”等多项荣誉称号。

2022年4月，招商局重庆交通科研设计院有限公司智能交通科研团队被表彰为2022年重庆市工人先锋号。