阿勒泰地区行政公署（简称阿勒泰地区
行署），由原阿勒泰地区革命委员会于1979年3月改组成立，是
伊犁哈萨克自治州人民政府的派出机关，原则由
伊犁哈萨克自治州人民政府管辖，由
新疆维吾尔自治区人民政府直接管辖。地区
行署驻
阿勒泰市。
1949年10月
中华人民共和国成立后，原阿山专员公署经改组后改名为“阿山区
行政督察专员公署”。1950年，阿山专区各县在“三区”政权基础上，相继成立了县人民政府；其中，青河县居民大多流散外地，故未成立县人民政府，暂作为一个区由
富蕴县代管，至1951年3月正式成立
青河县人民政府。
1950年10月，阿山区行政督察
专员公署改为阿山区专员公署。1954年2月
承化县改为阿勒泰县，阿山专员公署即改为新疆省人民政府阿勒泰专员公署，是
新疆省人民政府的派出机构，
伊犁哈萨克自治州成立后，属伊犁哈萨克自治州管辖。
“
文化大革命”中，1967年，阿勒泰
专署机构瘫痪，阿勒泰军分区即成立生产办公室代行专署职权；1969年10月，
阿勒泰专区革命委员会成立，为党、政合一的地区领导机构；1971年1月，又改为阿勒泰地区革命委员会。“文化大革命”结束后，1979年3月，
阿勒泰地区革命委员会改为
阿勒泰地区行政公署。