在市政府卫生行政部门领导下，组织实施全市卫生防病工作的技术保障部门，同时承担对区（市）疾病预防控制机构的业务指导、考核和技术示范职能。青岛市疾病预防控制中心的宗旨和使命是：预防控制健康危险因素、疾病、伤害和失能，提高市民健康水平和生活质量。 青岛市疾病预防控制中心有编制185人，现有在职人员185人，其中大学本科生63人，硕士以上研究生47人，博士研究生3人，具有中级以上职称的有115人，具有高级职称33人。并于2010年6月初完成了内设机构调整，调整后共设科室22个，其中行政后勤科室8个，业务科室14个，流行病学科、劳动卫生检验为卫生局重点学科和特色实验室；拥有高17层的办公业务大楼，中心实验室用房达6000余平方米，各种先进的检验、检测仪器1000余台（件）。2000年通过国家实验室认可，2005年通过复评审，出具的检测报告能够在50多个国家和地区实现双边和多边互认。检测能力为15大类616项参数/标准，涵盖卫生理化、卫生微生物、消毒、卫生毒理等。
该中心不仅是
山东大学公共卫生学院实习基地、
青岛大学医学院硕士研究生培养点，还是
北京大学公共卫生学院青岛教学科研基地，并与美国
德克萨斯大学泰勒卫生中心、
南加州大学健康促进和疾病预防研究所建立了科研合作关系，极大地带动了全市疾病预防控制各项工作的发展提高。
在市卫生局党委的正确领导下，青岛市疾病预防控制中心以文化建设、
制度建设为主线，切实做好了干部职工的积极性，中心凝聚力不断增强，中心的各项工作得到了快速发展，圆满完成了疾病预防控制各项工作任务，为保护人民群众身体健康、保障经济社会的和谐发展做出了应有贡献。
（一）完成国家、省下达的重大疾病预防控制的指令性任务，实施疾病预防控制规划、方案，组织开展本地疾病
暴发调查处理和报告；负责辖区内预防性生物制品管理，组织、实施
预防接种工作；
（七）负责对下级疾病预防控制机构的业务指导、人员培训和业务考核；指导辖区内
医疗卫生机构传染病防治工作。
业务科室：样品受理室、
接种门诊、传染病防制科、性病艾滋病科、慢病地病防制科、免疫规划科、消毒与病媒防制科、少儿卫生科、环境与食品卫生科、职业卫生与评价科、健康体检科、理化
检验科（理化实验室、消毒实验室、毒理实验室）、微生物与寄生虫检验科（病原微生物室、卫生微生物室）、健康教育所、卫生信息中心
青岛市流行病学重点学科专科概况 流行病学是研究特定人群中疾病、健康状况的分布及其决定因素，并研究防治疾病及促进健康的策略和措施的科学。青岛市疾病预防控制中心设有青岛市卫生行业唯一的流行病学重点学科。该学科有研究人员44人，其中主任医师3人，副主任医师12人，主管医师15人，医师17人。流行病学重点学科运用双生子队列、死因系统、开展大规模的前瞻性人群
流行病学调查，研究遗传因素、环境因素及遗传与环境因素在慢性病发生中的交互作用，为慢性病的预防和治疗带来突破性革命。对流感、结核、
霍乱、
病毒性肝炎、性病、
艾滋病、
手足口病等传染病进行流行规律、发病特点的研究，对发病情况和免疫效果进行监测，为传染病防控长效机制的建设提供科学依据。研究学生常见病如近视眼、龋齿、肥胖、贫血和青春期心理问题、伤害等发病原因及发生规律，探讨有效的预防措施和干预方法，提高青岛市学生的身心素质，促进学生的全面健康发展。通过对不同职业环境有害因素的检测，对不同工种和不同职业环境下职业病的发生规律的监测，分析环境与职业病发生的规律，研究改善、改良职业环境的有效方法和措施，探讨预防各种职业病发生的有效方案，为保障我市职工的健康提供科学依据。本学科先后承担科研项目12项，其中国际合作项目6项、省科技厅3项，厅局级项目1项，市科委项目5项。共有7项课题获奖，其中省卫生厅科技进步二等奖、三等奖各1项，市科委二等奖4项，三等奖1项。每年发表文章20篇，著作2本，有2篇文章收入SCI。
卫生检验学是研究与人类生存生活密切相关的空气、水、化妆品、食品、生物材料的
理化检测及其微生物学、病毒学、细菌学、
毒理学检验的综合性学科，以维护人体健康，达到人与自然的和谐发展。青岛市疾病预防控制中心卫生检验学科被评选为青岛市卫生行业特色专科，是主要进行食品安全、职业有害因素、饮用水安全、与食品安全相关的新出现有害物质等项目的检验。该特色专科人员结构合理，共有
专业技术人员46人，其中主任技师3人，副主任技师11人，硕士以上研究生13人，90%以上人员为大学本科。该学科
卫生检验中心拥有先进的实验设备，中心实验室面积达6000m2，拥有
气质联用仪、
液质联用仪、
液相色谱仪、
气相色谱仪、
原子吸收分光光度计、原子荧光
分光光度计、
紫外分光光度计、
DNA合成仪、
荧光定量PCR仪、
细菌鉴定仪、
凝胶成像分析等，各类检验检测设备共计1000余套，价值2000余万元。另外还有万级
洁净间、二级动物室、
P2实验室等。卫生检验中心于1995年通过了省级计量认证，并定期参加全国及省市的质量控制，均获质控优秀奖；2000年获得了
国家技术监督局与
中国实验室国家认可委员会联合颁发的“
实验室国家认可合格证书”，这在山东省卫生系统是第一家，在全国卫生系统是第三家。由此可以说达到了国内先进水平，并与国际水平接轨。2002年取得了省卫生厅建设项目职业卫生评价、
职业危害因素检测、卫生消毒用品检测资质证书；2004年取得了卫生部化学品鉴定资质（丁级）证书。2004年艾滋病确认实验室通过国家
疾病预防控制中心的考核验收。通过认证认可的检测能力有食品、化妆品、水质、职业危害因素、
室内空气质量、公共场所卫生指标、家庭装饰装修材料、卫生消毒用品、农药、包装材料、生物材料、毒理等13大类590多个产品标准/参数。本学科先后承担科研项目14项，其中国际合作项目2项、省科技厅2项，市科委项目3项，局级立项7。共有4项课题获奖，其中省卫生厅科技进步二等奖、三等奖各1项，市科委二等奖1项、三等奖1项。每年发表文章18篇，著作2本，有2篇文章收入SCI。