高肇，字首文，自称是
渤海郡脩县（今河北省景县）人，自称五世祖高顾，西晋
永嘉年间（307年～313年）时，因躲避战乱，迁居到高丽。高肇及其家族,通过冒姓
渤海高氏进入了中原士族社会的核心圈子。父亲高扬（《
北史》作高飏），于
北魏孝文帝在位初年，和其弟高乘信以及同乡韩内、冀富等人进入并归顺
北魏，官拜厉威将军，封爵河间县子，高乘信官拜明威将军，朝廷都以客礼相待，赐给奴婢、牛马、彩帛。而且孝文帝纳娶高扬之女、高肇之妹高照容为妃，生子宣武帝
元恪。
高扬死后，宣武帝追思舅氏，于
景明元年（500年）征召舅舅高肇兄弟等人。录尚书事、北海王
元详等启奏说：“高扬应追赠左光禄大夫，赐爵渤海郡公，谥号敬。其妻盖氏，应追封清河郡君。”宣武帝同意。并下诏让高扬嫡孙
高猛袭封渤海公爵位，封高肇为平原郡公，高肇弟高显为澄城郡公，三人同日受封。
起初宣武帝并未与舅氏接触，即将封爵时，赐给衣帽，在华林都亭接见高肇、高显。二人都很惶恐不安，以至动作举止都失却常态。数日之间，二人都富贵显赫起来。
景明二年（501年），咸阳王
元禧遭到诛杀，他的财物珍宝、奴婢田宅大多归于高氏所有。没过多久，高肇担任
尚书左仆射，兼任吏部、冀州大中正。高肇后来娶宣武帝的姑姑
高平公主为妻，升任
尚书令。
高肇出自夷土，当时人们都很轻视他。等到他掌管重要部门后，留心百务，孜孜不倦，世人都说他很能干。宣武帝初年，
六辅专政，后因咸阳王
元禧无事构逆，从此便专信高肇。高肇既无亲族，大结朋党，依附他的旬月之间便超升官阶，背逆他的不久便陷于大罪。以北海王
元详位居之上，他便谄言杀害。并且劝说宣武帝防卫诸王，以至宣武帝如同遭囚禁一样。当时贞顺皇后于氏突然死亡，人们都说是高肇所毒害。皇子
元昌去世，都说
王显没有及时给他治疗，是出于高肇的意思。等到皇弟京兆王
元愉出任冀州刺史，他畏于高肇恣肆擅权，遂至不轨。高肇谮言杀害皇叔彭城王
元勰。从此以后，朝野侧目，都畏惧厌恶他。高肇因此专权，与予官职任己高兴。高肇曾经与清河王
元怿在云龙门的外走廊下，忽起争执，终致不可开交。太尉、高阳王
元雍劝和制止他。
等到高肇的侄女
高英成为皇后之后，高肇更加宠信。高肇既处要害部门，每事都任己情定夺，他本无学识，动辄违背礼度，好改先朝礼制，出情妄作，减削封秩，抑制黜贬勋贵之人，由此怨声盈路。
延昌元年（512年），升任司徒。高肇虽然贵登
台鼎，还以离开要害部门怏怏形乎辞色，大家都嗤笑他。高肇的父兄封赠虽久，竟不改葬。
延昌三年（514年），宣武帝诏令改葬。高肇自己不去，只派其兄高琨之子高猛改服往代，迁葬于乡。当时人以高肇没有见识，哂笑但不责备他。
三年（514年），朝廷大举征蜀，以高肇为大将军、都督诸军为之节度。与都督
甄琛等二十多人都在东堂与宣武帝辞别，亲奉图略。
延昌四年（515年），宣武帝去世。朝廷撤回征伐军队。孝明帝
元诩给高肇和征南将军
元遥等人书信，告诉他们宣武帝去世的消息。高肇听说，哀痛惊愕不已，不仅是仰慕宣武帝，还有私忧身遭祸变的成分，朝夕悲泣，以至羸弱憔悴。将到京城时，夜宿
瀍涧驿亭，家人夜晚来迎接他，他都不相见。一直到城阙之下，衰服号哭，升到太极殿，奉丧尽哀。
太尉、高阳王
元雍先居西柏堂，专决众事，与领军
于忠秘密商议欲杀高肇。悄悄准备壮士直寝邢豹、伊瓮生等十几人埋伏在舍人省下。高肇哭梓宫完后，在百官前面走入西廊，清河王
元怿、任城王
元澄以及诸王等都窃窃言语眼神瞪他。高肇入省，壮士们拉住他，拖出去杀死。下诏暴露其罪恶，又说刑书未到，高肇便自尽而死，其余亲信党羽，朝廷都不追问，朝廷削除高肇官职爵位，只以士礼安葬他。等到黄昏，家人从西侧门把他的尸体运回家。
胡太后临朝听政后，下令特赠高肇为
营州刺史。
永熙二年（533年），孝武帝
元修追赠他为使持节、侍中、中外诸军事、太师、大丞相、太尉公、录尚书事、冀州刺史。
高琨，袭封渤海郡公，追赠镇东太将军、冀州刺史，谥号为静。