南阳卧龙综合保税区于2014年11月16日经国务院正式批准设立，位于南阳光电产业集聚区北部。这是继郑州新郑综合保税区后，河南省设立的第二个综合保税区。

2014年11月16日，国务院正式批准设立南阳卧龙综合保税区。这是继郑州新郑综合保税区后，河南省设立的第二个国家级综合保税区，对于南阳市经济社会发展意义重大、影响深远，标志着南阳经济从此拥有了接轨世界的大平台，标志着南阳在中原崛起进程中站在了新的制高点上，也标志着该市的对外开放将进入一个新阶段。南阳卧龙综合保税区选址在南阳光电产业集聚区北部，面积3.03平方公里，一期建设面积1.05平方公里。在区内，可开展国际转口贸易、国际采购配送、国际中转、商品展示等业务。区内企业享有诸多优惠政策，如进出境货物保税，区外货物入区退税，区内企业生产用设备、基建物资等入区免税，区内企业之间货物交易免征增值税、消费税等。南阳卧龙综合保税区建设周期为1年，到期必须达到封关运行条件。保税区将依托光电、装备制造等优势产业，功能定位以口岸、保税加工、货物贸易、保税物流四大功能为主，致力于建设成为河南省高端开放平台，形成郑州航空港综合实验区的延展区，成为中原经济区快速发展的助推器和中部地区崛起的增长极。

综合保税区和保税港区一样，是我国开放层次最高、优惠政策最多、功能最齐全、手续最简化的特殊开放区域。与保税区一词之差，却功能更为齐全，它整合原来保税区、保税物流园区、出口加工区等多种外向型功能区后，成为更为开放的一种形态，也更符合国际惯例。

综合保税区是设立在内陆地区的具有保税港区功能的海关特殊监管区域，由海关参照有关规定对综合保税区进行管理，执行保税港区的税收和外汇政策，集保税区、出口加工区、保税物流区、港口的功能于一身，可以发展国际中转、配送、采购、转口贸易和出口加工等业务。根据现行有关政策，海关对保税区实行封闭管理，境外货物进入保税区，实行保税管理；境内其他地区货物进入保税区，视同出境；同时，外经贸、外汇管理部门也对保税区实行相对优惠的政策。企业在综合保税区开展口岸作业业务，海关、商检等部门在园区内查验货物后，可在任何口岸(海港或空港)转关出口，无须再开箱查验。