口腔疾病研究国家重点实验室依托四川大学，实验室前身是
华西协合大学医牙研究室，创立于1936年，1991年被卫生部批准为卫生部口腔生物医学工程重点实验室，2002年被教育部门批准为
口腔生物医学工程教育部重点实验室，2007年通过国家科技部评审，批准建设口腔疾病研究国家重点实验室。重点实验室下设有口腔微生态与硬组织、细胞与组织工程、分子生物学、生物材料学等研究平台，拥有实验室空间5600㎡，并购置了一批国内最先进的精密仪器设备，总值超过3000万元。重点实验室现有科研人员53人，45岁以下的青年教师占研究人员总数的66%，留学归国人员占35%。
口腔疾病研究重点实验室以严重危害人类健康的重要口腔疾病为研究主线，运用
生命科学、材料科学、工程科学以及信息科学的新技术和新方法，对口腔感染性疾病、颌面部先天性发育畸形、口腔肿瘤等的发病机制和防治技术进行研究，并在口腔修复新材料、牙再生工程技术、天然药物防龋等领域开展具有原创性的基础探索和应用研究，以推动我国口腔医学的科学发展和人才培养，提升中国口腔医学学科水平。
近年来，口腔疾病研究国家重点实验室先后承担了国家“973”计划及前期项目、国家“863”计划项目、“十五”和“十一五”国家科技支撑计划、教育部和四川省重大科技项目、卫生部临床重点学科项目等一批重大科研项目，承担了
国家自然科学基金及部省级科研项目180余项，纵向科研经费达到4500万元；获得国家、部省科研成果奖21项，授权发明专利11项；发表科研论文1140篇，其中SCI收录190篇，出版学术专著34部，承办国际国内大型学术会议19次，加强了国内外学术交流合作。
近年来为国家培养了博士后人员17人，博士生128人，硕士生180人，台湾籍研究生41人。口腔疾病研究国家重点实验室已成为中国口腔医学科学研究和高层次人才培养的重要基地，成为在国内外有重要影响的口腔医学科学研究中心。 2005年口腔疾病研究国家重点实验室成功成为唯一进入国家“985”工程建设的口腔医学研究机构。重点实验室将瞄准国际口腔医学研究的前沿，进一步凝炼研究方向，汇聚创新人才，构筑科研平台，通过创新实验室运行机制，开展多学科联合攻关，提高整体实力，形成具有原创性基础研究及自主知识产权的口腔医学新理论与新技术为一体的口腔医学创新体系，成为国际一流的高水平口腔医学国家重点实验室。
口腔疾病研究国家重点实验室按照国家颁布的2020年科学技术发展总体
目标中人口与健康优先研究重点领域，结合国内外口腔医学的发展趋势和最新前沿以及我国口腔疾病的发病特点和分布情况，确定以严重危害我国人群健康和生存质量的口腔疾病为主线，开展发病机制的基础
研究和防治新材料、新技术的应用基础研究，运用生命科学、材料科学、工程科学、信息科学等多学科交叉的新技术和新方法解决存在的重大疑难问题，重点将在以下四个研究方向开展创新性研究工作：
重点研究牙再生组织工程，新型
牙科陶瓷修复材料和生物组织诱导材料的合成和性能解析以及口腔仿生梯度功能修复材料的研究。
重点研究口腔黏膜癌变的生物学机制和环境因素关系；口腔癌相关标志基因的生物学意义以及口腔癌细胞力学特性和口腔癌癌周
毛细淋巴管内皮细胞的生物学行为与癌转移的关系。